Googling脑蛋白质,带有3-D护目镜
艾伦脑阿特拉斯是互联网上的小鼠脑的基因组地图,被称为“大脑谷歌”。现在的地图集具有伴侣或大脑的工作分子,一种蛋白质的弹出书或蛋白质组地图,即那些基因表达。
蛋白质地图是“首先将定量蛋白质组织应用于成像,”Richard D. Smith,Battelle Smith,Energy's Pacificthethththindational实验室的Battelle Smith表示,他与UCLA大卫·格芬医学院的Desmond Smith带来了绘图努力。
“蛋白质是铅球运动员,是图片中最重要的部分,”Pnnl的史密斯说。“它们是做细胞工作的分子。”
微调这种蛋白质组地图将使蛋白质肖像看起来不同的其他人的健康脑的比较。地点和丰度的对比可以显示出阿尔茨海默,帕金森和其他神经疾病的最早可检测阶段。如果捕获和休息,他们希望这种疾病可能会被遏制。
在PNNL校园的DOE环境分子科学实验室进行了国家卫生资助研究所,在Genome Research在线版和目前在线神经科学网关(http://www.brainatlas.org.)。PNNL员工科学家弗拉迪斯拉夫A. Petyuk,Wei-Jun Qian和UCLA的Mark Chin是联合主导作者。
为了生产地图,团队表征中心脑切片为几十个1毫米立方体,或“体素”,“向我们展示蛋白质在大脑中出现的地方,它们在丰富的地方变化,”Pnnl的史密斯说。“我们标记了所有蛋白质,所以我们将有参考点,所以我们知道我们在大脑的不同部分和一只小鼠到另一只小鼠之间看着相同的蛋白质。”
到目前为止,蛋白质组学学学,其旨在用于识别蛋白质和统计蛋白质的任务的特殊改进的仪器,这一直类似于在蛋白质湖中飞越盲目。可以从给定的样品中辨别丰富和蛋白质类型,但是“了解他们的位置以及如何在不同案例中的大量变化对于了解他们所做的事情很重要,”Pnnl的史密斯说。
他说,来自艾伦脑地图集的切片,特别是信使RNA的基因组材料的变化应该类似于观察到的蛋白质组。这结果是这种情况,有助于验证新测量。
“艾伦脑阿特拉斯不告诉你的是哪种基因产生蛋白质和每个人的基因,”他说。与蛋白质组学的体素图结婚,研究人员能够产生“关于近1,200种不同蛋白质的定量信息”。
资料来源:太平洋西北国家实验室
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