基因调控对人类常见疾病的重要性

发表了一项新研究自然遗传学2007年9月16日(星期日)的研究表明，常见、复杂的疾病更可能是由控制基因活动的区域的遗传变异引起的，而不是由指定蛋白质密码的区域引起的。

这个令人惊讶的结果来自于威康信托桑格研究所的一项研究，该研究对270个DNA样本中近14000个基因的活性进行了研究，这些DNA样本是为HapMap项目收集的。作者观察了220万个DNA序列变异(SNPs)，以确定哪些影响基因活性。

他们发现，超过1300个基因的活性受到预测参与调节基因活性的区域的DNA序列变化的影响，这通常是近似的，但外部蛋白质编码区域。

“我们预测监管区域的变体对复杂疾病产生更大的贡献，而不是影响蛋白质序列的变体，”康沃尔·信托桑格研究所的高级作者Manolis Dermitzakis博士解释道。“这是对这一规模的第一次研究，这些结果证实了我们对复杂性状的自然变化性质的直觉。

“将DNA变体与疾病联系起来的大规模研究的一个挑战是确定变异的原因是如何导致疾病的：我们的分析将有助于发展这种理解，这是对遗传从遗传改善的道路的重要阶段。“

过去的稀有，单一的纤维化和镰刀细胞贫血等研究已经集中于对基因的蛋白质编码区域的变化，因为它们已经对人类遗传的工具可见。随着HAPMAP和大规模的研究方法，研究人员可以检查调节数以千万基因的活动的地区的作用。

HapMap项目建立了来自四个群体的参与者的细胞培养，以及一些样本来自家庭的信息，这些信息可以帮助理解遗传变异的遗传。该团队利用这些资源来研究细胞培养中的基因活动，并将其与DNA序列变异联系起来

“我们已经生成了在复杂性质潜在的变体映射中工作的调查人员的信息资源。协会的区域可以与影响基因表达的监管区域的签名相关联，这解释了Wellcome Trust Sanger研究所的高级调查员Panos Deloukas博士

WT桑格研究所博士后研究员芭芭拉·斯特兰奇博士说:“我们发现了强有力的证据，表明SNP变异接近基因——大多数调控区域所在的位置——可能对基因活动产生显著影响。”“尽管许多影响在所有四个HapMap种群中是共享的，但我们也表明，相当多的影响仅限于一个种群。”

他们还表明，细胞所谓的内脏基因的基本功能所需的基因不太可能受到遗传变异的影响。“这正如我们所期望的那样：你不能用太基本的生活进程弄得太多，我们预测我们会发现对这些基因的影响降低，”Drermitzakis说。

该研究还发现了影响距离很远基因活动的SNP变异。人类基因组的遗传调控是复杂且高度可变的:检测这种远距离效应的工具将扩大对致病变异的研究。然而，作者们注意到，270个HapMap个体的小样本量足以敏感到只检测到最强的影响。

该研究的结果在公共数据库中可用，例如用于研究人员的Ensembl。

这篇论文还附带了另外两篇研究哮喘和心脏研究患者样本中调控DNA变化的影响的论文。

来源：惠康信托桑格研究所

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