新的基因搜索方法揭示了克罗恩病药物的可能新目标

发现有助于复杂疾病的不同基因就像在众所周知的Haystack中寻找一个未知数量的针头 - 比其他小数小得多，通常将它们混合到背景中，并且许多人中的许多人彼此广泛地分开。但是，如果某些针头通过细线彼此连接，则可能将它们的丛生在一起。

使用一种结合统计工具的新方法，该统计工具识别与扫描整个基因组的高度自动化的基因狩猎技术相同的生物途径相互作用的基因，该研究人员的国际团队已经发现了涉及克罗恩病的新基因。克罗恩病是一种胃肠道炎症引起的慢性和痛苦的病症。由科学家们在费城儿童医院领导的研究人员表示，他们的方法拓宽了基因发现研究的力量，以抵消疾病治疗的潜在目标。

在克罗恩病等复杂的疾病中，许多不同的基因相互作用导致疾病。过去几年的研究已经确定了许多具有最强烈的基因，但许多具有重要角色的其他基因可能在大规模研究中产生较弱或模棱两可的信号，并且忽略了。“我们基于途径的方法从多个来源聚合信息以检测来自彼此相关的基因的适度效果，”儿童医院应用基因组学中心的主任，博士议员，博士。

这项研究今天出现在线美国人遗传学杂志。它将在3月13日在日记的印刷版中发表。

目前基因狩猎的主基因组关联（GWA），它使用自动分析设备扫过所有23例人染色体的全部范围，并检测与给定疾病相关的最重要的基因变体。这些变体，每种DNA碱的变化称为单核苷酸多态性（SNP）。

然而，个体GWA研究通常没有统计能力来检测涉及疾病发展的微妙但重要的变体。通过使用Kai Wang，Ph.D的算法，在应用基因组学中心，Hakonarson的研究团队创造了一种基于途径的方法，寻求沿相同的生物途径脱离相互作用或相关基因。“我们将基于途径的基于GWA数据应用于CROHN疾病，但在没有以特定疑似途径的假设开始的情况下进行了搜索，”Hakonarson说。“在数百种已知的生物途径中，从分析中浮出水面是最重要的基因已经已知与克罗恩病的生物学相关的基因。”

该途径，白细胞介素12（IL12）途径，治理涉及克罗恩病的发展的细胞受体。Hakonarson补充说，IL12途径可能更正确地称为IL12 / IL23途径，因为IL12受体信号传递在另一个受体上的信号传导，IL23。以前的其他研究人员的工作表明，阻断IL12或IL23受体的单克隆抗体表明了治疗CROHN病的一些临床成功。

"As we better understand the gene pathways operating in Crohn's disease, we are uncovering more potential targets for effective drug treatments," said pediatric gastroenterologist Robert Baldassano, M.D., a study co-author and the director of the Center for Pediatric Inflammatory Bowel Disease at Children's Hospital. He added that developing targeted therapies based on gene pathways might allow doctors to tailor treatments to a patient's genetic profile.

研究小组对1758名克罗恩病患者和1480名欧洲血统的对照组进行了初步的DNA分析。他们在另外三组欧洲和非裔美国人后裔中重复了这项研究，并且能够重复他们的结果。他们的研究是第一个使用基于路径的方法来分析GWA，而没有事先决定集中于一个特定的路径。

对于患有克罗恩病的儿童和成人，慢性胃肠道炎症会使他们日渐衰弱，这些新出现的基因数据可能为更有效的治疗打开大门。巴尔达萨诺说:“在生物途径的某些点上阻断细胞受体可能会产生临床改善，但会对免疫系统产生副作用。”“如果我们能阻断某一通路下游的其他分子，我们就可能获得更好的治疗方法，这种治疗方法可能对单个患者更有针对性，副作用更少。”

更多信息：Wang等人，“不同的基因组 - 宽协会研究将IL12 / 23途径与Crohn病，”人类遗传学，84，PP。2009年3月13日1-7。

资料来源：费城儿童医院

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