遗传危险因素增加儿童急性淋巴细胞白血病的几率
圣裘德儿童研究医院的科学家们已经确定了两种基因的遗传变异,这两种基因占儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)的37%,其中一种基因可能有助于预测药物反应。
这一发现源于对人类基因蓝图或基因组的首次完整搜索,以寻找最常见的儿童癌症ALL的遗传风险因素。发表在8月16日的在线提前号上自然遗传学,这项工作提供了第一个基于全面调查的证据人类基因组遗传在儿童ALL中起着作用。
Mary Relling,药学博士。他估计,遗传了ARID5B或IKZF1基因变异的人患ALL的可能性几乎是没有这种变异的人的两倍。她说,即使这样,风险仍然很低。大约每7.5万名美国人中就有一人患ALL。其中60%是儿童和青少年。
“基因变异本身不足以导致癌症。像所有癌症一样,小儿all是一种多因素疾病。”“但这些发现可能会让我们掌握这种疾病的机制和药物对它的反应。”
完全相同的基因ARID5B和IKZF1在英国ALL儿童中被证实发生了改变。这项研究由英国萨里的癌症研究所发表在同一期的《癌症杂志》上自然遗传学.
在圣裘德的研究中,研究人员与儿童肿瘤小组(COG)的同事合作,他们为患者提供了额外的病例基因分析.COG是一个国际医疗机构集团,在儿童癌症治疗的研究和临床试验方面进行合作。
研究人员扫描了441名ALL患儿和对照组17958名无癌症患者的基因组,发现了超过30万种常见的遗传变异单核苷酸多态性或单核苷酸多态性。
研究发现,在ALL患者和非ALL患者之间,有18个snp的频率存在显著差异。18个snp中的6个与ALL四种主要亚型中的一种有关。
这6个基因包括两个与ARID5B基因相关的snp。Relling说,对照组中大约11%的人从母亲和父亲那里遗传了有白血病风险的ARID5B变异。相比之下,38%的ALL患者中发现了同样的高风险ARID5B SNPs,这种ALL被称为高二倍体ALL。这种亚型约占所有患者的20%。
另外3个snp被追踪到7号染色体上相邻的IKZF1和DDC基因上。IKZF1也被称为IKAROS。St. Jude和COG的早期研究将IKZF1的获得性变化与ALL复发风险的增加联系起来。Relling说,新的证据表明,IKZF1基因的遗传变异与患ALL风险的增加有关,这强调了针对该基因变异的药物治疗的必要性。
她说,ARID5B和IKZF1在淋巴细胞或白细胞的正常发育中都起着重要作用。ARID5B属于一个制造转录因子的基因家族,转录因子有助于调节基因活性。Relling说:“如果他们有影响这些基因功能的遗传变异,这些可能是正常淋巴细胞被破坏并转化为癌细胞的途径。”
ARID5B基因的遗传变异也可能影响患者对化疗的反应,特别是对甲氨蝶呤药物的反应。“我们发现,同样的遗传变异也影响了白血病细胞中药物的积累。它积累得更好。这使得我们可以使用更低的剂量,仍然可以治愈白血病。”“这些发现可能会发现一种新的标志物,可以用来帮助决定不同ARID5B状态的患者使用甲氨蝶呤的剂量。”
科学家们不确定他们发现的snp是如何影响癌症风险的。但对与ARID5B基因相关的基因表达变异的研究表明,遗传变异具有生物学功能。研究人员仍然必须确定它是什么。
资料来源:圣裘德儿童研究医院