新发现的基因位点选择性地与在东亚洲男性前列腺癌有关
![Results from the prostate cancer GWAS of Japanese individuals. Each SNP is plotted horizontally based on chromosomal location and vertically based on the statistical significance of their association with prostate cancer. This study revealed novel associations for five SNPs (red and orange arrows) and confirmed several previously identified associations (blue arrows). © 2010 Hidewaki Nakagawa 发现元素的风险](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/uncoveringel.jpg)
前列腺癌是一个严重威胁男性世界各地,特别是那些年龄在65岁以上,男性癌症死亡的第二大原因美国和英国。
直到最近,男人生活在东亚的风险水平是低于几乎所有世界其他地区。这种情况正发生变化,然而,两者的结果生活方式和人口因素。“这增加的风险可能是由于转向西化的生活方式,包括食品、老年人口的快速增长,”解释Hidewaki中川在横滨的基因组医学中心。事实上,联合国的估计显示,东亚的人口比例是65岁以上的2009年和2050年之间将增加一倍以上,尤其是日本预计将有长者的最大比例。
除了这些环境因素,研究人员已经确定了数十个基因变化,似乎代表了潜在的前列腺癌的风险因素。所有这些被确定基于屏幕上执行个体的欧洲血统,但是一项新的基因组屏幕由中川和合作者在日本已经找到了一些新颖的遗传变异可能证明有价值的诊断和治疗的高危亚洲男性的增长。
带它去银行
中川的团队经常与来自生物科学家日本,一个行动于2003年发起,东京大学为了帮助科学家确定多元化的医疗条件的基础。“这个项目是开始收集样本的目标从300000个人至少有47个疾病之一,从66家医院的协作网络遍布日本,”他解释说。在这个特殊的研究中,研究人员获得DNA从3386年1583名前列腺癌患者和癌症控制对象。
中川和他的同事们使用这些示例执行所谓的全基因组关联研究(GWAS)。任何给定的人类基因组充斥着大量的个人核苷酸变化,也称为单核苷酸多态性(snp),驻留在和之间的基因。从GWAS研究者的目标识别单核苷酸多态性明显更可能出现在影响个人比控制;SNP与很强的疾病协会可能代表一个实际相关基因的序列变异或提供一个有用的物理标记识别邻近候选基因在相同的染色体区域。
团队的初步分析超过一百万不同的snp透露37在八个不同的基因位点变异显著相关,其中两个之前没有与前列腺癌。随后复制研究与一组独立的3001和5415名对照组的影响,使研究人员能够识别三个额外的位点,总共5小说snp。有趣的是,尽管许多癌症相关的单核苷酸多态性先前确定的欧洲人也表现出显著的联系日本主题,超过三分之一(12 31)没有。另一方面,最近的几次大规模的基因组研究使用类似的分析方法,但主要集中在北欧血统的受试者未能发现重大协会的任何确认的五个snp中川和同事。
了解候选人
超出了强有力的证据支持他们的明显的与疾病风险,大多数的这些小说snp是非常神秘的。他们两个,rs12653946 rs9600079,驻留在延伸DNA的长度从20 - 40000基地,不包含已知基因。另两个是位于non-protein-coding区域内一对基因;rs13385191 C2orf43发现,产生一种蛋白质的未知函数,而rs1983891坐落在基因编码所谓“forkhead盒P4”(FOXP4)转录因子。虽然它属于一个家庭的蛋白质与细胞周期调控和肿瘤发生有关,FOXP4尚未描述的功能。
最终的候选SNP似乎是最有趣的,因为它发生在一段DNA包含基因G protein-coupled受体C6A (GPRC6A),表达的蛋白质通常testosterone-producing睾丸间质细胞。“GPRC6A基因可能与性激素有关生产,如图所示(实验)在基因敲除小鼠,”中川说”,雄性激素水平在前列腺癌形成最重要的因素之一。“然而,需要进一步的分析来证实,这确实是该基因被rs339331标记。
虽然很多工作要做在描述如何确定的基因组区域导致患前列腺癌的风险,不过他们表示重要的增加已经大量snp与潜在的诊断或预后价值。“这是一个更大的数字比存在其他癌症,”中川说。
中川也指出,这五个snp似乎代表位点可能被用于前列腺癌易感性的选择性特性在特定的民族,这可能代表第一组Asian-specific癌症生物标记物的风险。“我们现在致力于试图建立一个风险评估系统对前列腺癌在日本和其他亚洲人通过结合许多SNPs和其他风险因素前列腺癌,”他说。
更多信息:——联合国。2009年世界人口老龄化。经济和社会事务,人口司,ESA / P / WP / 212 2009年12月,纽约。009年www.un.org/esa/population/publ…_workingpaper.pdf
——中国人,R。、赤松年代。Kubo说,M。高桥,。细野豪志,N。川口,T。Tsunoda, T。Inazawa, J。Kamatani, N。小川,O。,等。全基因组关联研究了5种新的susceptivility位点对前列腺癌在日本人口。自然遗传学42岁,751 - 754 (2010)。www.nature.com/ng/journal/vaop…租/ abs / ng.635.html