在对抗癌症PiggyBac加入军械库
研究人员已经开发出一种基因工具在老鼠身上发现的速度小说在癌症基因。系统-称为PiggyBac已经使用的团队确定新的候选人致癌基因。
PiggyBac系统的新发展使其成为一个强大的军械库的遗传方法研究人员挑选的遗传原因癌症。它将补充癌症基因组学和遗传学的进步,通过提供生物对人类突变被癌症基因组测序验证。
PiggyBac过程包括运输货物的遗传物质——叫转座子基因称为转座酶使用一个引擎。团队融入鼠标PiggyBac系统,转座子可以从基因到基因,从染色体,染色体、破坏或改变基因的活动,他们的土地。
“远不是破坏性的,这个过程让我们寻找基因潜在的癌症,”艾伦布拉德利教授说,从维尔康姆基金会桑格研究所和这篇论文的主要作者。“一些基因中断时,将推动细胞在肿瘤发展道路。当我们观察小鼠的肿瘤发展,我们可以搜索的转座子基因的分子指纹;这使我们能够识别基因中断原因。但什么是新模式的不同寻常之处是它的适应性——PiggyBac,我们可以看看特定器官,我们可以切换和关闭基因的基因,我们可以寻找癌症基因在整个基因组。
“这是全基因组研究的有机体版本。”
团队寻找小说63年癌症基因小鼠血液癌症。系统打开新的门基因组中:当研究人员检查了72个不同的位置,他们的转座子进入基因组时,他们发现一个了不起的2/5的这些遗传网站以前从未被发现。
”以及高亮显示该系统的潜在基因区域之前找不到,我们已经确定使用的新基因PiggyBac打开未来的研究令人兴奋的新途径,”罗兰Rad博士说,从维尔康姆基金会桑格研究所和第一作者在纸上。“例如,我们发现,一个基因,称为美籍西班牙人,中断在9个不同的髓系白血病小鼠肿瘤。事件频率的优点在人类癌症研究,当我们考虑到最近的研究已发现这种基因有一个角色在白血细胞的发展,我们可以对这一发现的潜力更加乐观。”
其他基因识别包括Hdac7,已知参与创建白细胞在胸腺,但到目前为止,没有研究在血液癌症;Bcl9,相当于人类的基因被认为是参与白血病。
研究人员现在可以详细看看人类基因组中的基因等价物,问他们的新基因扮演何种角色。癌症遗传学的挑战之一是癌细胞的基因组可以遭受成百上千的突变。通过观察癌症模仿鼠标,团队可以开始理解——在一个生物性水平上,在成千上万的突变,是原因。
前转座子研究人员经常使用其他方法,如病毒,导致突变并产生肿瘤。虽然这些成功识别遗传癌症的罪魁祸首血液和乳房,他们没有其他有效的癌症类型。
只有在最近几年,研究人员已经能够激活转座子突变高等生物的基因组,如老鼠——从一个模型称为睡美人。PiggyBac睡美人相比,具有很多优点,大大扩展了工具包提供给研究人员。但是两个系统也可以互相补充。
“这些转座子有特殊的偏好,特定的工作方式,“Pentao刘博士说,从维尔康姆基金会桑格研究所和一个作家在纸上。“虽然睡美人转座子槽进入基因组最舒服地根据一个模式,PiggyBac遵循另一个。所以,很自然地,一个系统会发现基因,另一个可能不会。真正令人兴奋的是,我们已经能够将两个系统合并到鼠标线,这样他们可以一起使用。
“通过优化PiggyBac以这种方式和分享这些工具与研究人员在世界范围内,我们可以希望推动癌症研究的新发现。”
团队开发了三种类型的转座子,这可以在基因组运往达到不同的效果。有关的一些基因会发现血液癌症,一些固体肿瘤,一些可以找到基因在两种。他们还开发了新方法,让研究人员激活转座子只有在特定的器官,他们正在研究——肺、肝脏、胰腺或任何其他组织鼠标。
PiggyBac模型现在努力识别基因,研究小组将进一步扩大业务范围——寻找基因潜在的一系列不同器官的癌症的老鼠。
更多信息:Rad R et al。(2010) PiggyBac转座子突变:癌基因在老鼠身上发现的工具。科学。