新技术精确定位了癌症患者和非癌症患者之间的基因差异
由弗吉尼亚理工大学弗吉尼亚生物信息学研究所(VBI)的科学家领导的一组研究人员开发了一种新技术，可以检测出区分癌症患者和健康个体的明显基因变化，并可作为未来的癌症易感性测试。
这个多学科团队，包括德克萨斯大学西南医学中心的研究人员，已经设计出一种新的DNA微阵列这使得他们可以用30万个探针测量人类基因组中的200万个微卫星(短而重复的DNA序列)。
微卫星往往因人而异，传统上用于取证和亲子鉴定，也被用于发现与脆性x或亨廷顿舞蹈病等许多其他遗传疾病有关的信息。这一进展有助于发现一种独特的微卫星变化模式乳腺癌没有出现在癌症患者DNA中的患者。通过对基因组全局变化的评估，研究人员确定，这种模式变化暗示了一种破坏癌症患者基因组的新机制，可能代表了一种新的乳腺癌风险生物标志物。这项研究的结果将刊登在即将出版的一期杂志上基因，染色体和癌症．该研究可在线查阅http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21240973．
“我们现在已经找到了一种新的生物标志物——一种可以用来评估你未来患癌症风险的指标，”VBI执行董事、领导该研究所医学信息和系统部的Harold“Skip”Garner解释说。“这是理解它们(微卫星)在基因组中的作用的努力的一部分，然后直接进行一些在临床实用的东西。我们刚刚发表的论文描述了一种技术，这种技术可以让我们使用一种独特设计的微阵列，非常快速、有效、廉价地测量这200万个地方……正是微阵列上的模式为我们提供了我们需要的信息。”
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只有一小部分微卫星与癌症和其他疾病有关，因为目前还没有一种有效的方法来评估大量的这些序列。这项技术使科学家们能够了解这些尚未被研究的部位的作用基因组这是第一次，可能有助于解释疾病中已知的遗传成分与那些已经被基因组研究解释的基因成分之间的差异。该工具可用于识别和更好地理解许多不同类型癌症的基因变化，并有可能作为通用的癌症生物标志物。它已经在雌激素相关受体γ (ERR-γ)基因中发现了一种新的生物标志物，这表明个体患乳腺癌的风险增加。该组织现在正在追求一些这样的目标癌症结肠癌、肺癌和其他癌症的易感性危险标记物。
