单细胞测序导致癌症研究的新时代
BGI是世界上最大的基因组学组织，开发了单细胞基因组测序技术，并在研究期刊中发表了两份用于癌症单细胞测序的研究表细胞。在今天发表的论文中，在同一问题上发表细胞，BGI研究人员应用了新的单细胞测序（SCS）方法，以鉴定基本血小板（ET，一种血液肿瘤）和透明细胞肾细胞癌（CCRCC，典型的肾癌）的遗传特征，并证明单身高度异质组织的细胞分析提供比先前的散装组织测序更清晰的肿瘤内遗传图像和发育历史。
BGI的SCS方法的可用性为单一核苷酸分辨率开启了肿瘤遗传研究的新方法，特别是对于通过先前的散装组织测序来难以识别关键突变的那些。该方法的单核苷酸分辨率使得能够应用于各种疾病和生物过程，例如组织，IPS或的细胞异质性研究干细胞，预植入遗传诊断和遗传重组的生殖细胞。
细胞是异质的多细胞生物。目前的高通量测序技术已应用于各种生物学研究领域，然而，其对研究复杂现象等肿瘤演化的显而易见的局限性，早期胚胎发育神经元科学和元基因组学使得它对异质样本无能为力。最近出现的单细胞分析方法，如Navin等人对乳腺癌的单核测序，有助于理解细胞异质性的生物学基础。
到目前为止，科学家们没有合适的方式探索单一的遗传学肿瘤细胞在单核苷酸分辨率下。为了克服这种缺陷，来自BGI的研究人员基于先进的多个位移扩增（MDA）开发了一种高通量单细胞测序方法，并使用衍生自提供DNA的健康个体（YH）的两个单个淋巴细胞细胞进行测试第一个亚洲二倍体基因组序列。“通过评估，我们发现我们的MDA的方法可以提供更大的分辨率和基因组覆盖，这将使单细胞分析在单核苷酸水平，灵敏度和特异性相对较高，”这是索引歌曲，其中的领先作者BGI的研究与项目经理。
BGI首先应用了其新的SCS方法来对血液肿瘤进行单细胞外壳分析，因为它更方便地推断出造血祖细胞异常增殖的发展过程。结果显示，Jak2阴性血液肿瘤可能由单克隆体细胞突变细胞产生，并鉴定了几种可在血液肿瘤起始和进展中发挥作用的若干已知和新的突变基因。因此，所识别的突变基因可能对未来的生物学研究感兴趣。
此外，为了更好地了解典型实体肿瘤的瘤内基因突变，BGI研究人员将这种新方法应用于肾肿瘤。该研究表明，这种肿瘤不太可能是由VHL和PBRM1两种最常见的突变导致的。这强调了在个体水平上评估和诊断癌症和患者以确定最有效的治疗方法的重要性。进一步分析表明该肿瘤不含任何显著的克隆亚群。肿瘤异质性的定量分析显示，大多数体细胞突变只发生在一小部分细胞中，不同等位基因频率的突变显示出非常不同的突变谱。研究人员还对一组98名肾肿瘤患者进行了基因突变筛查，并确定了可能导致这种肾肿瘤形成的关键基因。
“我们的试验研究表明肾脏肿瘤可能比以前认为更遗传的复杂性，并提供了可以导致研究个体肿瘤的新方法，以促进更有效的细胞靶向治疗的目的，”BGI副主任徐旭表示。“本研究还提供了单细胞外壳序列如何为单个实体肿瘤产生新的生物洞察的良好举例。”
“我们的两项研究表明了我们在更大的决议中识别复杂，群体的识别复杂，小型遗传变化的专有方法的力量，”BGI副主任yingrui li表示。“我相信我们的研究将使研究人员能够开发临床评估肿瘤的新方法，并促进复杂疾病和生物过程的研究。”
BGI执行董事Jun Wang表示，“BGI的单细胞测序技术将基因组研究提升到一个新的水平，使研究人员能够在生长，繁殖和发展，遗传和发展等生命过程中进行蜂窝水平进行生物学研究生物体。“
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