常见的基因变异可以确定自闭症患儿高危兄弟姐妹的自闭症风险

通过对常见遗传变异的识别,研究人员已经识别出57种单核苷酸多态性(SNPs),它们可以高度确定地预测患有自闭症谱系障碍(ASD)儿童的兄弟姐妹也会患上这种疾病的风险。研究结果发表在国际自闭症研究会议上。

自闭症谱系障碍是严重发育障碍中最常见的一种,患病率高达1 / 88。男孩被诊断为自闭症谱系障碍的可能性是其他儿童的四倍多,而自闭症谱系障碍儿童的兄弟姐妹的复发风险估计为18.7%。由于多项研究表明,早期评估和干预可以显著改善长期结果,早期识别有ASD风险的儿童已成为一个关键目标。

尽管最近的许多研究证明了这一点ASD的遗传模式在大多数家庭中是高度复杂的。虽然自闭症的基因检测仅限于识别拷贝数变异(CNVs),但只有大约10%的自闭症儿童中发现了与自闭症相关的CNVs。

研究人员正在寻找一种识别自闭症生物标志物的替代方法,他们将注意力集中在一些已被证明与自闭症障碍风险相关的常见遗传变异(或snp)上。虽然单个的snp不会导致ASD,但最近的研究表明,自闭症相关snp的组合可以高度确定地预测一个孩子是否会发展成ASD。

“通过观察性别特异性、风险相关、基因常见变异的组合,我们能够确定患有ASD儿童的兄弟姐妹有显著的法国埃弗里市IntegraGen公司研发副总裁、首席作者Francois Liebaert医学博士说:“更早地识别风险较高的自闭症儿童的兄弟姐妹可能会导致更快的转诊、更早的诊断、更早的干预和更好的预后。我们还希望在没有自闭症儿童的家庭中复制这些发现。”

这些发现建立在早期对发生在男性和女性中的8个与自闭症相关的SNPs的识别之上(使用性别特异性基因评分对受影响儿童的兄弟姐妹进行自闭症风险评估)分子自闭症

为了确定哪些snp与自闭症相关,研究人员使用了分析其他复杂疾病的技术。通过将全基因组关联研究(GWAS)的统计结果与来自多个来源的生物学信息(包括数据库和科学文献)结合起来,研究人员能够识别并优先考虑snp,并开发出针对性别的遗传评分来预测自闭症的风险。

这项研究包括了超过1100个有一个以上孩子被诊断为自闭症谱系障碍的家庭,被称为多重家庭,包括近2000个受影响的兄弟姐妹和600个未受影响的兄弟姐妹。患病儿童的男女比例接近4.2:1。发现队列包括来自自闭症患者遗传资源交换库(AGRE)的545个家庭。这些发现随后在627个家庭的人口中得到重复,其中339个家庭来自单独的AGRE收集,288个独立家庭的DNA样本来自华盛顿大学西雅图分校,目前保存在宾夕法尼亚大学。

外部合作者包括宾夕法尼亚州费城宾夕法尼亚大学医学院病理和实验室医学系的Gerald Schellenberg博士和Beth Dombroski博士,以及北卡罗来纳大学教堂山分校精神病学教授、自闭症之声首席科学官Geraldine Dawson博士。

通过对AGRE发现队列执行四个独立的GWAS,确定了与自闭症风险增加相关的snp:第一个是使用所有受影响的儿童;然后分别使用受感染的男性和女性进行GWAS;最后的GWAS仅限于未受影响的兄弟姐妹。GWAS研究中确定的每个SNP都得到了一个评分,评分基于它们各自的统计信息和可用的生物学信息的总和。对得分高于定义阈值的snp进行进一步分析,用有效的统计方法在更大的人群中测量估计结果的可重复性,以衡量它们与自闭症的关联强度。然后,作者利用个体风险相关SNPS的总和构建了性别特异性遗传评分模型。然后评估这些性别特异性基因评分区分患有或没有ASD的兄弟姐妹的能力。

法国巴黎法国国立卫生和医学研究所(INSERM, CEPH)人口遗传学研究主任Emmanuelle Génin博士说:“就像在这项研究中所做的那样,结合统计和功能基因组数据,在进行GWAS以识别与自闭症等复杂疾病相关的常见变异时,提高了从噪声中分离信号的能力。”ob欧宝直播nba“由于自闭症是一种具有复杂遗传病因的异质性综合征,这种方法增加了研究结果在独立人群队列中重现的可能性。”

这项研究发现,除了在之前发表的研究中发现的8个SNPS外,在最初的研究和复制研究中,有57个SNPS与自闭症保持了关联。57个snp包括26个与男性自闭症相关的snp, 26个与女性自闭症相关的snp, 5个与男性自闭症相关的snp在男性和女性中都与自闭症有关。据报道,与自闭症儿童的普通兄弟姐妹相比,患自闭症风险显著增加的男性和女性患自闭症的风险分别增加了2倍和4倍。

由IntegraGen提供
引用:常见基因变异鉴定自闭症儿童高危兄弟姐妹的自闭症风险(2012年5月17日),检索自2022年11月9日//www.puressens.com/news/2012-05-common-genetic-variants-autism-high.html
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