黑色素瘤：25种肿瘤的全基因组测序证实了阳光损伤的作用，揭示了新的遗传改变

黑色素瘤 - 最致命和最具侵略性的皮肤癌症 - 长期与在阳光下花费的时间。现在，由广泛的研究所和Dana-Farber癌症研究所的科学家领导的团队已经测量了25种转移性黑色素瘤肿瘤的全基因组，确认慢性阳光暴露和揭示肿瘤形成中重要的新遗传变化的作用。

在5月9日在线发布的文章中自然，作者提供了人类基因组景观的第一个高分辨率视图黑色瘤肿瘤。以前的遗传分析集中于许多类型的癌症肿瘤的展开，浓缩基因组的微小部分，为生产蛋白质的遗传密码。整个基因组含有丰富的遗传信息，并通过测序和分析25种转移性黑素瘤肿瘤 - 这是一个重要的技术和计算壮举 - 科学家可以更多地了解了黑色素瘤重要的遗传改变。

“整个基因组的测序肯定会增加发现的丰富性，这是一个全面的全面捕获，”达纳 - 法国癌症研究所和哈佛大学副教授，广泛研究所高级副教授Levi A.Garraway说医学院，以及本文的共同高级作者。

“通过观察整个基因组，您可以更准确地确定背景突变率和不同类别的突变，并且更自信地描述了黑色素瘤中紫外诱导的诱变模式，”迈克尔F. Berger，Co-First作者纸。他在广泛的癌症基因组分析集团和Garraway致力于研究科学家和计算生物学家，然后才能搬到纪念斯隆 - 克隆癌症中心。

当科学家们探讨了在广泛产生和分析的全部基因组数据时，他们发现遗传突变的速率随着患者的慢性阳光暴露而升高，证实了阳光损伤在疾病发展中的作用。

“人黑素瘤肿瘤的全基因组分析表明，本文的广泛和联合高级作者的高级助理成员，Lynda Chin表示，Lynda Chin表示，第一次存在许多结构重排。”以前在Dana-Farber和哈佛医学院，她现在是德克萨斯州德克萨斯大学癌症中心大学基因组医学系主席。

正如预期的那样，科学家检测到24个肿瘤中的24个中的已知BRAF和NRAS突变。两个基因都参与送到细胞生长中重要的信号。

另一种基因跳出来源：预先在患有肿瘤抑制途径的乳腺癌中涉及的PREX2，在44％的患者中改变。在107个肿瘤的较大验证队列中，突变的频率为14％。

PREX2在遗传破坏的收敛中突变，似乎加速肿瘤发育。它的突变不仅发生在通常打开癌基因的热点，一种癌症引发基因和向前驱动癌症。在通常可以看到当另一种类型的癌症的基因（称为肿瘤抑制剂时）的图案中，改变也散落在基因的长度上。

“这里的突变模式看起来更像肿瘤抑制基因，但从功能实验中，它表现得更像癌基因，”Berger说。

当PREX2正常工作时，它与蛋白质PTEN相互作用。PTEN是众所周知的肿瘤抑制剂，控制正常细胞的生长。Dana-Farber的Chin的实验室中的小鼠实验表明，PREX2突变以不完全理解的方式刺激肿瘤生长。

“我们仍然不能说我们确切地知道它是如何工作的，”Garraway说。“PREX2可能是一个非常有趣的新类别的突变癌基因，这些癌症基因将我们指向至少一个，也许更多的途径，这些途径值得在黑素瘤中治疗。”

PREX2的识别可以是冰山的尖端。

“通过这种无偏见的方法仍然发现新的黑色素瘤基因，如PREX2的发现和其在体内致癌性的证明，”下巴。

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