罕见儿童癌症基因组研究产生可能的预后工具
尤文氏肉瘤是一种罕见的癌症，常发生在儿童、青少年和年轻人身上。一项关于尤文氏肉瘤的基因组成或基因组的新研究有多个发现:一种以前未知的肉瘤亚型、与长期生存有关的遗传因素，以及确定了该疾病的原发期和转移期之间的一种基因变化，这可能导致更好、更有针对性的治疗。
研究人员从亨茨曼癌症犹他大学(University of Utah)的HCI研究所(HCI)使用了一种新的先进技术，称为分子反演探针(MIPs)来分析DNA的变化在尤因的基因组中肉瘤肿瘤。该报告今天发表在该杂志的网络版上癌症遗传学．
尤文氏肉瘤的新亚型
根据这项研究的主要研究人员，犹他大学儿科学副教授、医学博士约书亚·希夫曼(Joshua Schiffman)和HCI研究人员的说法，高达10%的肿瘤样本显示基因组某个特定区域的DNA缺失，包括ob体育开户网址一个名为SMARCB1的基因。同样的缺失在另一种侵袭性和致命的肉瘤横纹肌瘤中也被描述过。病理学家仔细检查了这些样本的诊断，确定它们不是误诊的横纹肌样肿瘤，而是同样具有横纹肌样特征的尤文氏肉瘤。
希夫曼说:“发现这个新的尤因肉瘤亚型特别重要，因为这种缺失的患者是长期存活的患者。”“它提出了关于这种肿瘤的生物学问题，以及这种类型的癌症患者是否需要不同的治疗方法。”
基因组因素与长期生存相关
研究人员还观察了尤文氏肉瘤基因组和病人的结果他们发现，8个基因组区域的因素与确诊后的长期生存存在不同程度的关联。他们将不含上述任何一种因素的样本与含有一种或多种因素的样本进行了比较。没有这些因素的患者的结果要好得多:80%的患者在最初治疗后没有复发，甚至更突出的是，100%的患者在诊断后存活了12年以上。对于具有一种或多种上述因素的患者来说，只有大约40%的人存活了那么长时间。
希夫曼说:“我们的结果将必须在更多的样本上进行验证，但MIPs为我们提供了在临床存档样本上进行验证的工具。”“显然，更多地了解带有这些基因组因子的癌症对于找到新的治疗方法至关重要，这将提高所有尤因肉瘤患者的总体生存率。”
转移性尤文氏肉瘤细胞的基因差异
目前关于癌症如何在体内扩散或转移的模型认为，原发肿瘤在某种程度上发生了变化，从而允许癌细胞分离并转移到身体的其他部位。研究人员比较了同一患者的原发肿瘤细胞(癌症的初始位置)、转移细胞和正常细胞之间的DNA差异。
希夫曼说:“我们发现一种特定的基因只存在于转移性肿瘤中，而不存在于原发肿瘤或正常细胞中。”“该基因以前曾被描述与其他类型的癌症有关，但没有尤因肉瘤。
“人们不会死于原发性肿瘤，”他补充说。“致命的是癌症在全身的转移和扩散。随着我们了解肿瘤转移的原因，我们可以寻找治疗方法，阻止原发肿瘤发生这种变化，或者在转移性肿瘤中已经发生这种变化时针对这种变化。”
使用存档的肿瘤样本
在美国，每年确诊的尤文氏肉瘤病例只有300到400例。希夫曼说:“尤文氏肉瘤的罕见性给癌症研究带来了一个问题。”“因为病例太少，过去很难找到足够的组织样本，对这种疾病的遗传学和生物学进行有效的研究。”
与其他基因分析技术不同，MIPs的质量非常高，基因组对保存在福尔马林和石蜡块中的临床样本进行全范围的高分辨率DNA分析，该过程被称为FFPE。“几十年来，FFPE一直是保存病理样本的标准技术，”希夫曼说。“但直到最近，基因组学技术还无法利用这些样本所代表的巨大资源。”
“我们分析了过去12年盐湖城初级儿童医疗中心尤文氏肉瘤患者的原发肿瘤FFPE样本。这听起来不像一个大的样本，但为了这个罕见的癌症它反映了某一年诊断的所有病例的10%，因此数量非常可观。”
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