2012年11月23日报告
用人巨细胞病毒表达的蛋白质映射
(欧宝娱乐地址医学Xpress) - 美国和德国的新研究已加入我们对人巨细胞病毒(HCMV)的理解以及它如何操纵它感染的细胞。
HCMV是一个很常见的疱疹病毒感染50-100%的成年人,通常没有效果,多年来它可以保持潜伏。在发展中国家的人群中,HCMV感染比在高级国家更常见。病毒可引起新生儿的出生缺陷,并且可能导致免疫系统受损的人民中严重甚至致命疾病。病毒也可能涉及在癌症中作用发展。
Noam Stern-Ginossar在加利福尼亚州旧金山大学的Jonathan Weissman实验室的新研究和美国和德国同事的团队看着病毒的蛋白质组,描述了所有表达的蛋白质。研究人员认为,由基因组编码的潜在蛋白质的地图,该蛋白质主要用于计算机模型,是不完整的。
首先在二十年前测序HCMV基因组,从那时起,已经测序了16种病毒的菌株。这是一个特别大的病毒基因组,大约240,000个碱基对。
该团队通过在人类HCMV感染期间映射核糖体的位置开始成纤维细胞。核糖体是细胞内的细胞器,其中制造蛋白质。然后使用它们质谱确定是否存在预测的蛋白质。研究鉴定了几百蛋白质未识别的基因组中的编码。
这DNA细分蛋白质的编码被称为“开放阅读框架”,并且基于基因组序列的分析,之前研究了预测存在200帧。在新的研究中,团队发现这些帧中的一些编码非常短蛋白质序列包含100个氨基酸或更少。他们还发现一些开放阅读框架在其他框架内。他们在蛋白质组中发现的复杂性令人惊讶和意外。
理解病毒基因组可以表达的蛋白质可以有助于确定病毒如何影响宿主细胞,以及如何破坏细胞的操纵。
在他们的论文中,发表在科学研究小组表示,它们可以使用组合核糖体分析和质谱法的方法来检查其他复杂的病毒蛋白质蛋白。
进一步探索
抽象的
人巨细胞病毒(HCMV)基因组20年前测序。然而,与其他复杂病毒一样,我们对其蛋白质编码潜力的理解远非完整。我们使用核糖体分析和转录分析来实验地定义HCMV翻译产品并遵循它们的时间表达。我们确定了数百个以前未识别的开放阅读框架,并通过质谱进行了分数。我们发现,调节替代转录物启动部位在实现HCMV蛋白表达的紧密暂时控制中起着广泛的作用,并允许从单个基因组轨迹产生多种不同的多肽。我们的结果揭示了对HCMV编码能力的意外复杂性,并说明了在生成这种复杂性时转录成绩的调节变化的作用。
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