基因组“热点”为自闭症的原因提供线索,其他障碍
![Spontaneous mutations in the germline are a significant factor influencing genetic risk for autism spectrum disorders (ASDs). Using whole-genome sequencing of autism families, Michaelson et al. (pp. 14311442) determine the intrinsic characteristics of the genome that influence regional mutation rates and quantify the effect of paternal age on global mutation rate. Mutation rates vary widely throughout the genome, and regional hypermutation emerges as a factor determining the contribution of individual genes to risk for ASD and other disorders in the population. Cover artwork by Evgeny Buryat Onutchin. Credit: Michaelson et al., <i>Cell</i>. Artwork by Evgeny Buryat Onutchin 自闭症基因中的变异热点](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2012/mutationhots.jpg)
由加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的研究人员领导的国际团队发现,基因组中的“随机”突变毕竟不太随意。他们的学习,在期刊上发表细胞该研究显示,人类基因组某些区域的DNA序列非常不稳定,其突变频率是基因组其他区域的10倍。与自闭症和各种其他疾病有关的基因有特别强的突变倾向。
突变或“热点”的簇对自闭症基因组不是独一无二的,而是是一种内在的特征人类基因组,根据主要调查员Jonathan Sebat,Phd,精神病学和细胞和分子医学教授,以及贝斯特分子基因组学中心的主任神经精神疾病在UC圣地亚哥。
“我们的调查结果向自闭症的潜在基础提供了一些洞察力 - 令人惊讶的是,基因组并不害羞地滋补其重要基因”Sebat说。“相反,疾病导致基因往往是高度的。”
SebaT和来自中国圣地亚哥和BGI基因组中心的SebaT和合作者测序了相同双胞胎的完整基因组自闭症谱系障碍和他们的父母。当他们将双胞胎的基因组比较了他们父母的基因组时,科学家们鉴定了许多“种系”突变(两番双胞胎中存在但不存在于母亲或父亲中的遗传变异)。
近600岁种系突变- 超过60亿基对- 在研究中测序的10对相同的双胞胎中被检测到。在每个孩子中检测到平均60个突变。
“我们发现的突变总数并不令人惊讶,”Sebat说:“这正是我们将基于正常人类所期望的突变率。“作者发现的是令人惊讶的是,在基因组的某些地区倾向于聚集的突变。当科学家们仔细观察突变的遗址时,他们能够确定一些基因组区域是”热“的原因,而其他地区很冷。
“可变性可以通过内在的性质来解释基因组该研究的主要作者、加州大学圣地亚哥分校博士后雅各布·迈克尔森说。“我们可以根据局部DNA序列和染色质结构,即DNA打包的方式,准确预测基因的突变率。”
研究人员还观察到个体儿童中突变聚类的一些显着实例,其中一次发生突变均匀发生。“当多个突变发生在同一个地方时,这种事件的机会更大的破坏基因,”迈克尔森说。
研究人员抑制了高端基因可能与疾病有关。当他们预测基因的突变率时,作者发现已与自闭症相关的基因比平均基因更加变得更加变质,这表明一些有助于自闭症的遗传罪行是突变热点。
作者观察了其他疾病基因的类似趋势。与显性疾病相关的基因往往是高度变质的,而与复杂性状相关的基因突变率降低。
“我们计划在未来的研究中专注于这些突变热点,”Sebat说。“在更多患者中测序这些区域可以使我们能够识别更多的自闭症遗传危险因素。”
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