与乳腺癌风险相关的SNPS改变先驱因子FOXA1的结合亲和力

达特茅斯科学家们表明，患有乳腺癌风险的所有SNP的一半以上位于远处区域，并由FOXA1的结合，雌激素受体-α（ER）功能的蛋白质，根据在期刊上发表的纸张自然遗传学十一月。

杰森摩尔，博士学位，博士学位，博士学位，达尔斯茅斯 - 北路诺里斯棉癌中心和其他研究人员的遗传学研究所的三世纪遗传学教授，以及达特穆茅斯棉癌癌症中心的生物信息学助理主任使用了一种新的方法，这些方法结合了传教士，表观囊组学和基因型注释基因组的非编码区域的归纳乳腺癌细胞并系统地鉴定与乳腺癌风险相关的SNP的功能性质。

“了解生物学背后的生物学基因危险因素打开门来识别新的药物目标，“摩尔博士说。结果表明，对于乳腺癌，大多数风险相关的SNP调节Foxa1结合。首先，他们完全连锁不平衡（LD）与SNP定位于Foxa1绑定的网站，而第二个，这些连接的SNP能够以显着的方式改变FoxA1的募集。

Pioneer因素，如Foxa1，以及谱系特定因素，如ESR1，利于建立细胞身份的转录程序。因此，研究人员表明，大多数可以破坏正常乳房细胞标识的SNP调节FoxA1先锋因子的结合。

基础的机制乳腺癌风险- 分配的SNP是未知的。与大多数其他复杂的特征一样，这些风险相关的SNP地图到基因组的非编码区域。研究人员展示了乳腺癌相关的SNP富集FoxA1和ESR1转录因子结合位点和H3K4ME1组蛋白改性。富集依赖于因子，细胞类型和癌症类型。支持GWAS鉴定的风险相关的SNP的监管机制的证据稳步增长。已经显示出100bp转录开始部位内的差异等位基因占用的杂合网站与差异基因表达具有强烈关联，并富含GWAS鉴定的SNPS31。Foxa1先驱因子的结合是染色质开口和核心定位的中央，有利于转录因子募集的核心定位。此外，Foxa1是建立对ESR1阳性雌激素刺激的转录程序的核心乳腺癌细胞。

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