大数据分析确定预后标记RNA在常见的乳腺癌

相结合的大数据分析三个大的基因组数据集可以通过癌症基因组图谱确定了37个RNA分子,可以预测生存患者最常见的乳腺癌。

俄亥俄州立大学研究人员的研究综合癌症中心——阿瑟·g·詹姆斯的癌症医院和理查德•j•Solove研究所(OSUCCC -詹姆斯)最初分析信使核糖核酸(信使rna)和微rna表达、DNA甲基化数据和466例的临床研究浸润性导管癌,最常见的类型的乳腺癌。

分析确定30 mrna和七个小分子核糖核酸——短的RNA片段——都与病人相关的结果在44临床和分子子类,包括早期肿瘤。然后研究人员验证预后签名使用全基因组表达的数据从2399年乳腺癌患者在八个独立的组,发现它表现好于其他RNA签名目前用于乳腺癌危险分层。

研究结果发表在美国国家科学院院刊》上。

“这是首次在乳腺癌预后签名或其他类型的癌症,它结合了信使RNA和微,“说,第一作者和Stefan Volinia博士研究员,副教授分子病毒学、免疫学和医学遗传学OSUCCC——詹姆斯,“我们相信这简洁的RNA签名证明可以用于乳腺癌患者的临床管理。”

首席研究员卡洛•m . Croce博士教授分子病毒学、免疫学和医学遗传学和主任人类癌症基因指出,大多数基因的RNA签名以前没有与乳腺癌有关,与其他预后签名,这个不包含基因参与肿瘤细胞周期或等级。

“大多数这些预后基因是新来的,因此他们可能代表新药物靶点,“Croce说,世卫组织还约翰·w·沃尔夫椅子在人类癌症基因。“他们也是小说与未知功能的基因,需要进一步研究。”

他指出,这些基因也可以适合早期检测的血液测试。

要点相关的研究结果包括:

• 发现了RNA签名可能预测对治疗的反应,以及预后;
• DNA甲基化是用来证实mRNA表达之间的关系和整体生存;
• 签名包括突变PIK3CA及其途径,表明PIK3CA / AKT2 / PTEN轴是一个重要的预后和独立的辅助因子;
• 最高的预后价值整合的签名是在早期阶段I和II乳腺癌,这有可能成为一个有价值的生物标志物在临床实践中签名。