在TCGA映射的致癌签名是个性化治疗的指南

新癌症疗法的临床试验设计历史上专注于肿瘤的起源组织，而是来自纪念斯隆 - 肯特癌症中心的研究人员在9月26日发表的纸张自然遗传学支持一种新方法：基于肿瘤的基因组特征，而不是体内的原产地的组织。

这是众所周知的出现癌症这是一个多步骤的过程，但由于美国国家卫生研究院资助的癌症基因组图谱(TCGA)的努力，以及其他大规模的癌症基因组学努力，这一过程首次可以从分子细节上观察到，绘制影响人类细胞中20,000个基因中的任何一个的突变和其他分子事件。

现在，两名主要假设已被证实基因组分析来自12种不同肿瘤类型的3000多种样本：有限数量的特定遗传事件似乎导致大多数肿瘤亚型，无论原产地是什么组织，都可以通过致癌签名进行分组。这些致癌签名主要独立于癌症所产生的特定组织表明某些组织药物组合对选择不同的患者可能是有益的类型的癌症。

”在未来的临床试验,我们设想某种类型的子宫内膜癌患者,例如,可能是注册在同一个试验作为亚型结直肠癌患者,和病人选择临床试验可以引导癌症基因组学分析在诊所,”克里斯•桑德表示的一个主要调查人员斯隆-凯特琳基因组数据分析中心。“这项工作旨在帮助设计此类试验，并开发更个性化的癌症治疗方法。”

揭示分子细节中癌症事件组的能力基于过去十年的三个主要技术和科学发展。新的高吞吐基因组技术和较低的运营成本使得来自数千个肿瘤的遗传数据集合。许多实验室中癌症基因组学中积累的经验和知识教授美国癌症中许多分子改变的哪些可能有助于肿瘤发生。连接数据和知识，新算法和用于计算生物学领域的大数据分析的方法提供了在大海捞针中找到众所周知的针头的能力：导致癌症的分子遗传签名并将它们与肿瘤亚型和潜在疗法联系起来背景极高的信息噪音。

纪念斯隆 - 肯特队及其在TCGA的同事和国际癌症基因组联盟计划计划扩大这些综合分析到数万种肿瘤样本。在13,000多个肿瘤样品中的分子肿瘤景观的一瞥已经在CBIoportal用于癌症基因组学http://www.cbioportal.org.。

研究中的主要作者是Giovanni Ciriello，Nikolaus schultz，纪念斯隆肯特的计算生物学中心的Chris Sander。

---

---