免疫系统途径中的基因变体与人体微生物的组成相关
免疫相关途径中的人类基因可能与个体微生物组的组成相关,这是指在美国的科学家们报道的细菌和身体上的其他微生物,2013年10月24日,在美国人类遗传学学会波士顿年会。
“这些基因在炎性和免疫途径中显着富集,形成了高度富集的互动网络,”助理教授,遗传学,细胞生物学系助理教授,培训教授说明尼苏达州明尼苏达州。
该研究是第一种全基因组和微生物组型调查,以确定人类之间的相互作用遗传变异和居住的微生物的组成人体。
人体,尤其是肠子的皮肤,生殖器区域,嘴巴和其他地区被量氧化的细菌和其他微生物殖民。“微生物物种的组合物的转变与多重慢性条件相关,例如糖尿病,炎症性肠疾病和肥胖,”Blekhman博士指出。
Blekhman博士及其合作者发现了证据遗传93人调查的15个体位点对微生物组成的影响。“我们在我们的研究中发现,遗传变异与微生物组在两个层面相关,”他说。
在个体层面,称为主成分分析的数学程序表明,遗传变异与人的微生物组的整体结构相关。
在物种级别,宿主遗传变异与单个丰度之间的潜在相关性细菌种类被识别出来,博莱克曼博士,他们进行了大部分研究,而安德鲁·克拉克实验室的科学家,博士·斯科尔克·斯科曼·苏格兰·苏格尔曼群岛康奈尔大学分子生物学和遗传学系的遗传学教授,伊斯卡,纽约州。克拉克博士是摘要的高级作者。
为了鉴定居住在每个人体部位的细菌物种,研究人员从人类微生物组项目(HMP)中挖掘序列数据,这是一个遗传人体微生物居民的国际计划。
使用系统级关联方法,研究人员表明,与免疫系统途径相关的基因的变化与15个宿主体位点中的微生物组组合物相关。
研究人员分析了来自1000个基因组项目的测序数据,阐明了人类及其微生物体之间的进化史,旨在提供全面的资源人类遗传变异。
他们发现途径中的基因与之相关的作品个体的微生物组在人口上有很大差异。“此外,在最近的研究中已经显示了许多基因,以便在选择性压力下,”Blekhman博士说。
“结果突出了宿主免疫在确定身体上的细菌水平方面的作用,并支持微生物组在驱动细菌相关宿主的演变方面的可能作用基因,“ 他加了。
Blekhman博士目前正在研究宿主遗传学和微生物组的综合作用,以影响个人对癌症患者这种疾病的敏感性。他的目标是解开宿主基因组变异与肠道微生物组之间的相互作用结肠癌发病率,进化和治疗反应。
进一步探索
用户评论