快速检测BRAF突变在癌症组织样本的方法
新的诊断平台检测BRAF基因突变在黑色素瘤和其他癌症是更快和更准确的在诊所比目前使用的标准方法,这有助于加快诊断和治疗,根据结果提出在AACR-NCI-EORTC国际会议上分子靶和癌症治疗,10月19号举行。
大约50%的黑色素瘤和其他的频率更低癌症类型、海港BRAF突变致癌基因。到目前为止,已经有超过30种不同的癌症相关的BRAF突变。最常见的是BRAF V600突变。
新的分子诊断(MDx)原型平台由Biocartis梅赫伦,比利时,可以检测BRAF V600突变在大约90分钟,无需样品制备,并与标准方法95%协议批准临床实验室改进修正案(CLIA)。
“当你做分子检测BRAF突变的方式是在诊所进行,通常需要三到四个星期拿回结果。很多时间都花在准备样品,包括激光显微解剖分离肿瘤细胞的DNA,”菲利普Janku医学博士说博士,MD安德森癌症中心的肿瘤学家在休斯顿,德克萨斯州。“MDx平台,需要大约两分钟添加新鲜,冷冻,或肿瘤石蜡包埋标本样品盒和不到90分钟结果。这个平台能给你答案在绝对史无前例的时间框架。
“我们使用MDx检测BRAF突变的证据原则。这个新平台将能够检测各种突变,包括喀斯特,表皮生长因子受体,和其他人有fda批准的靶向治疗,”他补充道。“不幸的是,我们仍然无法提供靶向治疗病人一旦他们来到诊所,因为它需要时间来做分子测试。确定正确的治疗患者早期癌症护理是至关重要的。我们需要更多地投资于发展中分析和诊断平台。”
Janku和他的同事们使用了79档案肿瘤样本测试MDx平台。BRAF突变状态获得使用CLIA-approved方法是对所有这些样本可用。结果使用MDx生成平台和CLIA-approved方法79个样本的75年协议。MDx平台与差异的四个样品,但不是CLIA-approved方法检测BRAF V600E突变在结肠癌样本,和MDx平台没有检测BRAF突变在剩余的三个样品,据报道由CLIA-approved BRAF-mutation积极的方法。
感兴趣的,两三个BRAF阳性病人的肿瘤样本突变CLIA-approved方法但不是MDx平台接受BRAF / MEK抑制剂CLIA结果基础上,他们没有回应治疗。
推荐者:菲利普Janku,医学博士博士。
标题:BRAF突变测试档案肿瘤样本的一部小说,快速、完全自动化的分子诊断原型平台
背景:小说、快速、准确的诊断系统需要进一步实施个性化治疗。BRAF基因的突变可以提供可操作的目标癌症治疗黑色素瘤和其他肿瘤类型。
方法:分子诊断(MDx)原型平台(Biocartis,梅赫伦,比利时)是一个完全集成的实时pcr系统灵敏度高(1%)和快速周转时间(< 90分钟),不需要样品制备和< 2分钟的时间。档案formalin-fixed石蜡包埋的肿瘤样本(1到5 x 10µm刨花)与先进的癌症患者(pts)之前检测V600 BRAF突变CLIA-certified分子诊断实验室(pcr测序,Sequenom MassARRAY)测试了BRAF V600突变使用MDx原型平台。MDx原型平台和BRAF V600突变原型试验仅用于研究目的。不同的方法和治疗结果之间的一致性BRAF / MEK抑制剂进行了分析。
结果:七十九分(黑色素瘤,n = 34;结直肠,n = 20;乳头状甲状腺,n = 6;卵巢,n = 4;其他癌症,n = 15)提供组织和CLIA实验室BRAF结果确定(BRAF V600突变,n = 49;野生型BRAF, n = 30)。70分的人同样的组织块用于MDx和CLIA BRAF结果(V600突变yes / no)在67年整合(96%;卡巴0.91;95%可信区间0.81 - -1.01;差异:从CLIA V600E突变只在前列腺癌,从CLIA V600E突变只在黑素瘤,V600E突变MDx只有在结肠癌)。 In addition, BRAF results by MDx were discrepant with CLIA in one case (melanoma) in the mutation subtype (V600K vs. V600E). In all 79 pts (including 9 patients with different blocks tested) MDx and CLIA BRAF results (V600 mutation yes/no) were concordant in 75 (95%; kappa 0.89; 95% CI 0.79-1.00) of them (additional discrepancy: V600K mutation from CLIA only in colon cancer). Of 49 pts with BRAF mutations detected by MDx, 30 were treated on protocols (on the basis of the CLIA lab results) with BRAF/MEK inhibitors and 8 (27%) had a partial response. Of interest, 2 of 3 pts with BRAF mutations from CLIA, but not MDx, received a BRAF/MEK inhibitor and did not respond. Detailed patient characteristics, mutation types and discrepancy analysis will be presented.
结论:BRAF突变V600 MDx原型平台是一个快速(周转时间约1.5小时)和简单的(< 2分钟的时间)测试确定BRAF突变状态,有96%的一致性CLIA实验室结果在相同的组织块。
