深度,综合基因组分析重新分类较低级脑肿瘤
低级脑肿瘤的综合基因组分析将它们分为三类,其中一类具有分子标志和胶质母细胞瘤的存活率,脑肿瘤最致命的脑肿瘤,研究人员在美国癌症研究年度2014年度会议上报道。
“立即临床意义是,一群肿瘤患者以前分类为较低等级的肿瘤应实际上被视为胶质母细胞瘤患者,并接受那种护理灭菌族化疗和辐照的标准,”博士博士表示,“德克萨斯州长安德森癌症中心大学生物信息学与计算生物学助理教授。
“在这三种分子簇中分类较低等级的肿瘤更准确地表征,而不是用于组和等级肿瘤的当前方法,”Verhaak说。
定义三种肿瘤簇的枢轴分子标记 - IDH1和IDH2基因的突变状态和损失染色体武器verhaak指出,1p和19q - 已经在临床护理中进行了常规检查,因此可以相对迅速实现新类别。
Verhaak和同事分析了来自癌症基因组地图集(TCGA)脑肿瘤研究的数据。
缺乏IDH1 / 2突变急剧减少生存
脑肿瘤产生巨大的胶质肿瘤,或者脑的支持细胞,现在通过微观的组织学 - 特征来分类 - 通过显微镜观察和它们的起源细胞,星形胶质细胞或少偶突胶质细胞。
以这种方式分类,2级和3级oligodendrogliomas和星形细胞瘤表现出中位数的整体患者存活范围从三到十年。这与14个月相比,患者胶质母细胞瘤多形形- 复杂和积极的星形细胞瘤。
Glioblastomas占Gliomas的55-60%,较低的星形细胞瘤,其含量为15-20%,少突茂物12-20%,组合寡核苷口为5-10%。
研究人员综合分析了254种TCGA较低级Gliomas,用于基因,蛋白质和微RNA表达,DNA甲基化和基因拷贝谱通过类别进行群集案例。然后他们进行了一个包含所有数据的“集群集群”分析。
“结果基于IDH1和IDH2基因的突变状态和染色体臂的致染染色体臂的突变状态,较大指向较低级胶质瘤的自然分组到三个超级簇的结果。
以前的TCGA研究表明,胶质母细胞瘤患者突变其肿瘤中的IDH1 / IDH2具有改善的预后。Verhaak表示,这些突变是良好预后的标志物还是实际上在横截突然肿瘤进展中具有作用。1P19Q的共同删除已与增加有关瘤对少突卵瘤患者的化疗和更长的存活敏感性。
每个分子基团包括来自所有等级和星形细胞瘤,少突细胞瘤和寡核细胞瘤的类别的肿瘤
较低等级的胶质瘤的三个分子超级簇有:
- 野生型IDHI1和IDH2没有突变。这些肿瘤类似于胶质母细胞瘤,患者中位数在18个月内生存。
- IDH1 / IDH2突变和染色体臂1p / 19q完好无损。没有占优势的组织学或等级类型,大约七年的中位生存。
- IDH1 / IDH2突变和1P / 19Q的共同缺失。该群集主要由少突(84%)组成,并在大约八年内生存中位。
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