研究发现，基因面板可能是全基因组测序的有用的、更便宜的替代方法

多达10%的女性乳腺癌或卵巢癌的个人或家庭历史至少有一个基因突变,如果知道的话,会促使他们的医生推荐的变化护理,根据一项新的研究由斯坦福大学医学院的研究人员。

研究中的女性在BRCA1或BRCA2中没有突变（这些突变基因与遗传性乳房和卵巢癌)，但他们的其他癌症相关基因确实发生了突变。

这项研究是利用多基因面板进行的，研究人员根据已知的疾病知识选择了一些可能的基因元凶，从而快速而廉价地对其进行排序。尽管这样的专家小组已经在临床上广泛使用，但目前还不清楚它们的使用是否能帮助患者或影响医疗建议。

“虽然全基因组测序可以在正确的条件下显然有用，考虑对每个人来说可能会过早，“詹姆斯福特，曼德斯·福特，指导斯坦福的临床癌症遗传遗传计划。”基因面板在测序之间提供中间地面，只需像BRCA1这样的单一基因我们肯定参与疾病风险，并在基因组中测序每个基因。这是一种专注的方法，应该允许我们捕捉最相关的信息。“

福特是医学和遗传学副教授，是这项研究的资深作者，该研究将于4月14日发表在《科学》杂志上临床肿瘤学杂志。医学博士、医学、健康研究和政策助理教授、临床癌症遗传学项目副主任Allison Kurian是这项研究的主要作者。

福特在美国医学协会期刊上的一份文件中是一个共同作者，这突出了临床上临床上的全基因组测序的挑战和机遇。虽然该研究表明，全基因组测序可能是潜在的救生，但涉及测序组成一个人DNA的数十亿个核苷酸的挑战，然后将结果转化为临床护理建议是显着的。

Kurian说:“这项研究表明，使用基因面板来筛查潜在的有害变异，对某些患者群体的临床治疗是有用的。”“它还显示病人，其中一些人已经给血液样本对于10年前的研究，我们愿意并有兴趣获得这类后续信息，并将其纳入他们的医疗保健计划中。”

基因面板允许研究人员从单一血液样品中同时学习几种基因的序列。它认为，只有少数选择基因的突变筛选比全基因组测序更快，更容易，更便宜。该技术通常侧重于约21,000个人基因的少于100个。但到目前为止，很少有研究已经调查了是否在预定的嫌疑人小组上归巢，实际上可以帮助人们。

在这项研究中，库里安和福特评估了42个基因的序列，这些基因已知与乳腺癌或其他癌症的发展有关，或与DNA修复途径有关，这些DNA修复途径可以将潜在的危险突变扼杀在萌芽状态。这项研究中的血液样本来自198名女性，她们在2002年至2012年期间接受了斯坦福临床癌症遗传学项目的BRCA1和BRCA2检测。在测试时，这些女性被问及是否愿意捐献额外的血液样本用于未来的研究。

198名女性中，57人携带BRCA1/2基因突变。福特和库里安发现，在141名没有BRCA1/2突变的女性中，有14人的42个基因中有一个出现了临床可操作的突变。(可操作的突变是一种与风险增加密切相关的基因变异，因此临床医生会建议改变常规护理，例如增加对携带者的筛查。)

我们通过电话联系了14名女性中的11人，另有10人接受了遗传咨询师和肿瘤学家的后续预约，讨论新的发现。一名妇女的家人在给她血样后死亡，他们也接受了咨询。六名参与者被建议每年进行乳房核磁共振成像检查，六名被建议定期进行胃肠道癌症检查;许多患者收到了不止一个新的建议。

一个女人，具有乳腺癌和子宫内膜癌的历史，了解她的突变导致林奇综合征，一种增加许多类型癌症的风险的病症。结果，她的卵巢除去并经历了结肠镜检查，鉴定了一种初前癌息肉以去除。

“使用这些基因面板的一个重要问题是，它们是否能让我们提供额外的遗传指导和筛查，”库里安说。“我们发现，参与者对额外的信息很感兴趣，也很愿意接受，他们对结果普遍感到满意，这有助于他们做出有关临床护理的决定。”

然而，用基因面板筛选不消除不确定意义的变异问题。当基因序列偏离共识时，使用该术语，但这种变化的临床效果是未知的。该研究中的141名女性中的每一个都有关于所研究的42个基因中的两个不确定意义的两个变体。

“全基因组测序也存在这个问题，”福特说，“随着我们收集到更多有关这些基因中特定突变影响的数据，这个问题应该会消失。”美国国立卫生研究院(National Institutes of health)赞助的临床基因组资源(Clinical Genome Resource，简称ClinGen)旨在加快对临床重要变异的识别和解释。

研究人员表示，即使研究表明，基因面板在某些群体中可能有用，可能是在常规人群中常规使用前的一段时间。

福特说:“这是一个滑坡。”“我们需要知道这些癌症有多普遍突变在一般人群中。我们还需要意识到，至少在一段时间内，很可能每个人都会有一个或多个意义不确定的变体。这是一个人想知道的信息吗?是有用的吗?10年后，随着我们对这些变化的临床意义了解的更多，这种情况可能会改变。”

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