MRSA感染的基因组测序预测疾病严重程度
抗生素抗性病原体MRSA的涂抹(耐甲氧二脲金黄色葡萄球菌)仍然是公共卫生问题,特别是在医生中试图确定受感染患者的适当治疗方案。细菌病原体,如MRSA,导致疾病部分因毒性,或细菌损害宿主组织的能力。今天在线发布的研究基因组研究,研究人员使用MRSA的基因组序列预测哪种分离株是一种高毒性,因此可能是个性化MRSA感染的治疗。
为研究MRSA的毒性,“标准方法一直是专注于单一或少数基因和蛋白质,”来自巴斯大学的罗兹·梅西斯说。然而,这并不总是成功,因为毒性是许多人编码的复杂性状遗传基因座。
在这项新研究中,作者使用了来自90 mRSA分离物的全基因组序列,以鉴定超过100种与毒性相关的遗传基因座。尽管属于相同的ST239克隆,但隔离物在毒性大大变化。
重要的是,剧毒分离株共享共同的遗传签名。通过在MRSA Genome中寻找这种签名,研究人员能够预测哪种分离物是最有毒的,因此在用于感染小鼠时更容易引起严重疾病。
“随着基因组测序的成本和速度降低,序列感染有机体的基因组变得越来越可行,”Massey说。在临床环境中,测序可用于决定MRSA治疗过程。例如,临床医生可以更积极地治疗高毒性感染,包括确定已知某些抗生素来减少毒素的表达。患者还可以更密切地监测并发症,并与他人隔离,以帮助控制感染的传播。
虽然许多参与MRSA的新型遗传基因座毒性在本研究中鉴定出来,仍有待确定每种影响疾病。除了检查其他MRSA菌株的基因组外,诸如特别抗生素的US300菌株外,作者还正致力于将其方法应用于其他细菌病原体,例如链球菌肺炎,这是婴儿和年龄段儿童死亡的主要原因五。
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