研究为肿瘤的遗传分析带来了重大进步

研究为肿瘤的遗传分析带来了重大进步

每个肿瘤都是独特的,需要特殊的治疗。为了确定适当的治疗方法,必须对肿瘤细胞的遗传活性进行彻底和完整的分析。代尔夫特理工大学的研究人员与哥伦比亚大学和安东尼·范·列文虎克医院的研究人员合作,在这类分析方面取得了显著的改进。研究结果于4月4日和10日发表在科学期刊上PNAS公共科学图书馆遗传学

识别新的癌症基因的一种方法是使用病毒。他们可以插入他们的进入生物体的DNA,比如老鼠。这些基因物质的变化——突变——导致老鼠体内产生某些肿瘤。通过对肿瘤进行基因分析并识别突变,就有可能发现是哪些基因导致了肿瘤的发生

基因表达分析

“我们将这种技术与代尔夫特理工大学代尔夫特生物信息实验室的生物信息专家Jeroen de Ridder博士解释道。”显示了肿瘤中所有基因的活性。我们可以看到某个基因是“开启”还是“关闭”,或者介于两者之间。这意味着我们可以精确地描述突变是如何影响肿瘤中的基因活动的。”

De Ridder补充道:“这一研究原则并不新鲜,但最近的进展带来的附加价值在于分析的完整性。”在代尔夫特,我们的工作主要集中在信息学方面的研究。使用一个回归模型,我们现在可以在同一时间确定突变对所有基因的影响。这为基因突变对基因活性的影响提供了许多新的见解。此外,通过统计分析和现有数据集的使用,人们对DNA的哪些部分容易发生这种类型的突变有了更深入的了解。在此基础上,我们得出结论,现行的分析方法往往产生不正确的结果。

“在医学界,越来越多的人意识到,每种肿瘤都是独特的,因此实际上需要特殊的治疗。”我们的方法增加了对每种肿瘤进行单独治疗的可能性和需要的理解。”


进一步探索

新的突变定义了两种类型的骨肿瘤

更多信息:“利用基因座表达特征分析确定肿瘤发生的调控机制。”Eunjee Lee, Jeroen de Ridder, Jaap Kool, Lodewyk F. A. Wessels, Harmen J. busemaker。PNAS2014;2014年4月2日提前出版。293111. www.pnas.org/content/early/201…full.pdf + html

逆转录病毒和转座子整合谱的染色质景观。Johann de Jong, Waseem Akhtar, Jitendra Badhai, Alistair G. Rust, Roland Rad, John Hilkens, Anton Berns, Maarten van Lohuizen, Lodewyk F. A. Wessels, Jeroen de Ridder。公共科学图书馆遗传学。发布日期:2014年4月10日。

引用:研究带来了肿瘤遗传分析方面的重大改进(2014年4月17日)
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