肿瘤抑制基因TP53在90%最常见的儿童骨肿瘤中发生突变

圣裘德儿童研究医院 - 华盛顿大学儿科癌症基因组项目发现肿瘤抑制基因TP53中的突变90％的骨肉瘤，表明改变在骨癌发育早期发挥关键作用。该研究今天发布于期刊之前在线发布细胞报告。

TP53的发现几乎每一个骨肉瘤改变也有助于解释骨肉瘤治疗中的长期悖论，这就是在标准剂量放射治疗的原因对肿瘤的原因很大。调查结果遵循第一个整体基因组测序骨肉瘤每年诊断为约400名儿童和青少年，使其成为最常见的儿科骨肿瘤。

“骨肉瘤治疗在20多年的情况下保持不变，并且治愈率在大约70％上停滞不前。该研究为新的疗法奠定了基础，并且更多立即识别出在之前的研究中错过的TP53中的许多突变，这些研究不包括全基因组测序。，“联合对象作者迈克尔·戴尔，博士学位，霍华德休斯医学研究所调查员和圣裘德发育神经生物学系成员。靖辉张，博士，圣裘德计算生物部的成员，是另一作者。

TP53携带用于组装P53蛋白的说明，在DNA修复和细胞死亡中起作用。P53的失活有助于肿瘤细胞存活放射治疗。以前的研究估计，TP53在骨肉瘤的四分之一突变，表明这种肿瘤患者的大量比例应该应对辐射。戴尔说，这不是这种情况。

“随着全基因组测序，我们正在进入TP53各种突变促进骨肉瘤的发展的新见解，”华盛顿大学学院基因组研究所主任，博士表示，博士学位医学在圣路易斯。“此信息在设计治疗方案方面非常有用。”

该研究涉及32例患者34例骨肉瘤的全基因组测序。患者的正常基因组也被测序。

该研究表明，55％的TP53突变是由结构变化引起的。当染色体断裂并重新组装时，会发生这些改变。骨肉瘤只是具有TP53突变的第二个癌症，其由染色体重排而不是点突变，这在构成基因的DNA中的少量变化。“这表明导致骨肉瘤的细胞可以特别易于染色体断裂或更好地耐受在发生时耐受断裂的影响，”染料说。

除了TP53之外，测序表明骨肉瘤肿瘤的肿瘤与影响许多其他癌症基因的结构变异串联。这些是在改变时的基因，是已知或怀疑引起癌症的。除了一个肿瘤之外的所有肿瘤在癌症基因中具有至少一种结构变异。该清单包括ATRX和RB1基因中的经常突变，其在其他小儿实体瘤中改变。可疑的癌症基因DLG2也突变成骨肉瘤的一半。

肿瘤的一半也包括异常大量的DNA点突变，这些突变均在染色体断裂附近聚集。这种局部化的超责来称为KATAEGIS，首先于2012年在乳腺癌中鉴定。本研究中鉴定的超折叠区域不包括TP53，ATRX或其他经常改变的基因骨肉瘤，但染料表示，该发现是对这种癌症的标志的基因组不稳定性的另一个指示。

该研究还产生了一个新的测试，以流线识别TP53的结构变化。该测试可用于筛查其他癌症或组织库中存储的肿瘤样本的变化。“这项测试使我们有可能询问p53结构变异的患者是否与其他TP53患者有不同的结果突变“戴尔说。”这将有助于我们识别重点临床研究努力的地方。“

该测试是由Armita Bahrami，M.D.是圣裘德病理系的助理成员开发的。她和陈辰，博士，计算生物学部的员工科学家，是本文的首先作者。

该研究是小儿癌基因组项目的一部分，该项目于2010年推出，以利用基因组测序技术的进步，以改善一些最具侵略性和最不理解的儿童癌症的理解和治疗。从那时起，该项目的排序为700年轻的完整正常和肿瘤基因组癌症耐心。

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