一种新的网状工具通过生物距离有效地优先排序疾病导致基因
![High school students Benjamin (center) and Mark (right) Mazel used their computer programming skills to help Postdoc Yuval Itan (left) improve the accessibility of the Human Gene Connectome, a tool to help biologists make connections between genes. 一种新的网状工具通过生物距离有效地优先排序疾病导致基因](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2014/anewwebtoole.gif)
一欧宝娱乐地址种本质上是基因导航系统的新工具已经得到升级,它可以帮助生物学家识别人类基因之间的联系和测量基因之间的距离。现在,就像谷歌地图一样,任何人都可以访问人类基因连接体,而无需经过计算生物学的训练,也不需要学习特殊的语法。
通过使用新的在线人类基因连接体,医生、免疫学家或任何其他研究者都可以插入潜在致病因素的名称基因进入搜索字段并根据称为生物距离的新度量排列它们。
它并不总是那么容易。原始版本的人体基因连接器需要某人不仅可以下载大量的数据,还要打开终端窗口和键入代码行。该要求促使其中的“终端命令线恐惧症”发作了一些,该项目,项目背后的主要研究人员以及Jean-Laurent Casanova的传染病人类遗传学的ST.Giles实验室的博士·艾丹表示。
“对于该系统工作来说,我们需要广泛访问它,我们已经完成了这一点,这归功于两个人的努力高中学生“伊朗说。
学生们,本杰明和马克·米泽,通过大学的夏季科学研究计划置于实验室,并花了他们的夏天,使系统成为更用户友好的界面。他们是发表的文件的共同作者BMC基因组学上周宣布了该网站的首次亮相。
该系统产生的生物距离度量可以牵连到一种疾病的单个基因,这是卡萨诺瓦实验室的目标。通常,这个过程从一个数百或数千的列表开始候选基因在病人体内携带突变。研究者首先在已知导致疾病的基因中寻找突变,如果没有突变(通常情况下),那么下一个问题是:在这个列表中,哪些基因与已知导致疾病的基因属于同一途径或具有相似的功能?
搜索通常到此结束,因为文献搜索变得势不可当,而其他传统工具受到限制。去年,当Itan和他的同事们在《美国国家科学院院刊》上首次描述人类基因连接体时,他们提出了一个新的解决方案。
“我们现在可以采取任何两个人类基因,然后通过一点击按键导航和测量其中两个之间的距离,基本上以与汽车一起使用GPS导航的方式,”伊朗说。“在这种情况下,导航的输入涉及由基因编码的蛋白质之间的物理结合相互作用而不是从街道到街道行驶。”
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