药物目标数据库让研究人员将旧药物与新用途进行匹配
有成千上万的药物可以抑制成千上万的致癌基因异常。其中一些药物现在正在使用,但许多药物被搁置在货架上,或者可以用于最初批准的疾病之外。这些药物的重新利用依赖于将药物与目标匹配。该杂志最近发表了一项研究生物信息学描述了一种新的数据库和模式匹配算法,使研究人员能够评估合理的药物和药物组合,并推荐了一种新的药物组合来治疗耐药非小细胞肺癌。
“大多数癌症都有不止一种基因变化。即使是基因靶向药物,其影响也往往超过其指定的目标。所以挑战是匹配的与许多影响与癌症的药物,很多原因,最好的地图药物影响到目标,”Choon Aik队效力谭博士说,调查员在科罗拉多大学癌症中心和生物信息学副教授铜医学院。
人类基因组中大约有500种激酶,每一种都代表着潜在的重要意义药物目标。Tan将数据库描述为一个包含500列的电子表格,每个列代表一个激酶。每一行都是一种药物每一行都是药物对激酶的活性。
“想象一下,你知道一种癌症是由五种激酶共同作用引起的,”Tan说。“我们的方法将允许你查询这种模式的数据库,并发现最符合遗传需求的药物或药物组合。”
由于这些药物中有许多已经获得了FDA的批准,可以用于治疗其他疾病,因此与药品开发人员重新开发这些药物相比,重新定位这些药物用于新疾病的过程涉及的范围和费用要少得多。
Tan和他的同事们利用这项技术推荐了一些可以关闭非小细胞肺癌产生耐药性的激酶的药物。这是一个重要的问题——许多肺癌依赖于EGFR基因的过度激活,但当使用像吉非替尼或埃洛替尼这样的EGFR抑制剂时,癌症倾向于激活其他“激酶”,使癌症绕过这种依赖。Tan和他的同事们询问是什么激酶让肺部活动癌症为了逃避吉非替尼,以及其他药物可能关闭他们。
答案可能就在辉瑞公司(Pfizer)研发的波沙替尼(bosutinib)身上。2013年,该药物获得了美国食品药品监督管理局(FDA)的批准,用于治疗慢性髓系白血病。这种药物会与人体的能量来源ATP争夺激酶的空间,从而阻止激酶被激活。结果表明波舒替尼可能会抑制激酶依赖EGFR的肺癌需要在EGFR抑制剂的挑战下发生突变。
在egfr依赖的测试中肺癌Tan和他的同事表明,吉非替尼和波沙替尼的药物“显示了加性和协同效应”。
Tan希望这种机制能够成为普遍的做法,他的团队现在将把这种合理的药物组合转交给加州大学癌症中心和其他地方的研究人员,让他们将这些药物进行人体临床试验。
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