研究发现最常见肺癌的新基因组变化(更新)
来自癌症基因组图谱(TCGA)研究网络的研究人员在肺腺癌(最常见的肺癌亚型)中发现了一种众所周知的致癌途径的新突变。对这些基因组变化的了解可能会扩大这种疾病的可能治疗靶点的数量,并有可能识别出更多具有可治疗突变的患者,因为许多针对这些突变的有效抗癌药物已经存在。
TCGA由国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI)共同资助和管理,两者都是国家卫生研究院的一部分。的另一种不太常见的形式的TCGA分析肺癌他在2012年被报道患有鳞状细胞癌。
这项新研究于2014年7月9日在线发表在该杂志上自然研究人员检查了230个肺腺癌样本的基因组、RNA和一些蛋白质。在四分之三的样本中,科学家最终确定突变使一种被称为RTK/RAS/RAF的细胞信号通路超负荷运转。
“TCGA分析的综合性质使这些发现及其潜在的治疗意义成为可能,”NIH主任弗朗西斯·s·柯林斯(Francis S. Collins)说。“我们希望这为未来精准医疗的工作奠定基础。”
影响RTK/RAS/RAF通路的突变可能导致其停留在“on”状态。因此,促进癌细胞增殖和存活的信号不断产生。然而,目前可用的一些药物抑制了这一途径的异常活性,并促进了患者的治疗反应。
“结合早期TCGA对鳞状肺癌的分析,我们现在对许多导致肺癌的遗传途径有了全面的了解,”NCI主任Harold Varmus医学博士说“基于这些知识,我们现在可以寻找更好的途径抑制剂来改善患者的预后。然而,就目前而言,停止吸烟或永远不吸烟仍然是减少肺癌死亡人数的最可靠的方法。”
在该小组对肿瘤样本的初步扫描中,研究人员在62%的样本中发现了会增加RTK/RAS/RAF通路活性的基因突变。受影响的基因是致癌基因,或者当突变或高水平表达时有可能导致癌症的基因。因此,这些肿瘤样本被归类为癌基因阳性。
为了确定额外的改变,研究人员观察了DNA拷贝数的变化,或基因组中DNA片段的删除或扩增(倍增)导致的基因数量的变化。在此过程中,他们检测到两个致癌基因的扩增,ERBB2和MET,它们是RTK/RAS/RAF通路的一部分。基因扩增通常导致细胞中编码蛋白的表达增加。
既然这些扩增已经被确定,临床医生也许可以用现有的或正在开发的药物来治疗那些有特定基因变化的肿瘤患者。
“非常惊人的是,我们现在已经在超过75%的病人与肺腺癌哈佛医学院、丹娜-法伯癌症研究所、布罗德研究所的医学博士、博士马修·梅尔森(Matthew Meyerson)说,他是该项目的主要研究人员之一。
进一步的分析发现了其他可能在肺癌发展中发挥重要作用的基因。其中一种基因NF1的突变之前曾在肺癌中被报道过;NF1是一个已知的肿瘤抑制基因,调节RTK/RAS/RAF通路。NF1的突变也使该途径超速运行。另一个突变基因RIT1也是RTK/RAS/RAF通路的一部分,这是第一个将该基因突变与肺癌联系起来的研究。
“这项最新的TCGA研究再次证明了TCGA数据的力量、深度和广度,”NHGRI主任Eric Green博士说。“这些结果让我们对一种重要癌症的发展和行为有了重要的基因组新见解。”
总的来说,几种形式的肺癌是全世界癌症相关死亡的最常见原因,每年死亡人数超过100万。NCI估计,在被诊断为肺癌的患者中,只有17.5%的人在5年后还活着。
肺腺癌是美国最常见的一种肺腺癌,发生在靠近肺外部的组织中,可以广泛传播。虽然吸烟是主要的危险因素,但腺癌也是终生不吸烟者中最常见的肺癌类型,暴露于二手烟会增加20%到30%的肺癌风险。
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