假基因可能为生物标记物提供更清晰的理解

唉，这个吃力不讨好的假基因。这些基因的“穷表亲”功能失调，不受宠爱，似乎没什么用处，已经失去了蛋白质编码能力。它们包含的物质对生物体的生存不是必需的，而且是清除基因组废物的“最后一站”。

没有任何更多。假基因日的到来可能要感谢休斯顿德克萨斯大学安德森癌症中心的科学家们。

韩亮博士是癌症中心生物信息和计算生物学学系的助理教授，他正在推进对这些在很大程度上被忽视但越来越吸引人的基因奇异现象的认识。他和他的团队完成了一项研究，在代表7个病人的2808个病人样本中生成了假基因表达谱癌症。这意味着分析3780亿个RNA序列来测量近10000个假基因的表达水平。

结果表明，假基因表达分析的科学可能在解释这一过程中发挥重要作用癌症通过帮助医学专家发现新事物而发生生物标记物。研究结果发表在今日出版的《科学》杂志上自然通讯。

对生物标记物的理解对于开发针对特定肿瘤部位的治疗方法，以及对患者如何应对各种癌症和治疗方法的新认识是很重要的。生物标记物是一种分子，可以指示某种状况或疾病的存在，并越来越多地被用于测量身体对治疗的反应。个性化医疗这一新兴领域是建立在基于生物标志物为患者定制治疗的基础上的。

梁的研究新颖之处在于，对假基因的理解依赖于对大量患者样本的分析。以往的研究受到患者样本组规模的限制。梁的团队分析了癌症基因组图谱研究项目提供的数据。该项目由国家卫生研究院下属的国家癌症研究所和国家人类基因组研究所支持，正在研究20多种不同类型癌症的基因组变化。

梁教授说:“这项研究调查了七种癌症亚型，包括乳腺癌、肾癌、卵巢癌、结肠直肠癌、肺癌和子宫癌。”“在所有癌症类型中，伪基因表达揭示的肿瘤亚型与其他分子数据定义的亚型表现出广泛而强烈的相似性。”

梁相信，这项研究突出了假基因表达分析作为研究癌症机制和发现预后生物标志物的新“金标准”的潜力。这些生物标记将允许医学专家更准确地预测癌症生存率。

Liang说:“单凭假基因表达就可以准确地对子宫内膜癌的主要亚型进行分类。”“值得注意的是，在肾癌中，假基因表达亚型不仅与患者生存显著相关，而且结合临床变量有助于对患者进行分层。”

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