全外显子组测序更接近成为“新家庭历史”
大约四分之一的3386名患者的DNA为临床全外显子组提交测试获得了一个已知的基因疾病诊断相关,通常结束漫长的寻找答案为他们和他们的父母,说贝勒医学院的研究人员部门分子和人类遗传学和儿科贝勒人类基因组测序中心和德克萨斯大学健康科学中心在休斯顿。ob体育开户网址
在网上报告的美国医学协会杂志》上,科学家们由Drs。实验室主任杨yap整个基因组实验室贝勒,和克里斯汀•英格分子和教授人类遗传学贝勒和高级主管贝勒的医学遗传学实验室,发现分子诊断(即基因突变或变异有关疾病)在25%的大群情况下-确认在这个更大的组患者诊断产量从他们最初的报告中第一次出现在250例新英格兰医学杂志》上一年多前。
“这份报告的结果,我相信,将永远改变未来儿科实践和医学作为一个整体,”詹姆斯·r·Lupski博士说,分子和人类遗传学和儿科教授贝勒和报告的合著者。ob体育开户网址“这只是一个时间问题,基因组学动作在医生的名单之前要做的事情,并要求制定一个鉴别诊断。这将是新的“家族史”,更好的是,让你重要的变异来自于父亲和母亲和新的突变导致疾病易感性。”
事实上,大部分病人的诊断是继承了一个新的突变(在卵子或精子)这不是以前见过他们的父母。
”的常规应用新的基因组方法在诊所不仅获益的病人改变我们思考的方式研究,”理查德•吉布斯博士说主任贝勒医学院人类基因组测序中心和这份报告的作者之一。
“这是美好的看这个大团队的同事衔接从诊所的病人最先进的基因技术给家庭的答案,以前没有,”dr . Arthur Beaudet表示,分子和人类遗传学教授系主任时整个基因实验室开始,开始贝勒医学院的医学遗传学实验室。
“诊断适用于整个组未确诊的3386名患者接受全外显子组测序2012年6月至2014年8月,“Eng说,2000个连续的患者报告的详细分析。
过程涉及的DNA测序患者使用新的测序技术称为下一代测序和比较这些结果正常参考。任何疾病相关的突变也比父母的DNA来确定孩子继承自父母一方或双方更好地理解这种疾病的原因。整个外显子组测序在这项研究中,还发现了医生的方式可以干预临床改善或消除负面症状和给家人更多的信息可能的疾病过程。
除了确认更大的组患者诊断率25%,最新的研究表明,罕见遗传事件在很大程度上有助于疾病的易感性,杨说,第一作者的《美国医学会杂志》研究。
主要贡献者疾病新创事件的一个变化发生第一次化妆的基因(称为孟德尔突变)的一个病人,单亲的二体性(一个人继承了突变的两份相同的父母),镶嵌性和拷贝数,她说。
“临床外显子组测序可以协助诊断多种疾病诊断困境,”Lupski说,德克萨斯州的一个临床儿科遗传学家儿童医院。许多患者在研究中被称为从得克萨斯儿童或其他医疗中心在美国。
“罕见变异和孟德尔疾病疾病人群的重要贡献者。这是在人口遗传学家的思想形成鲜明对比调查(通过全基因组研究协会)常见变异导致疾病的易感性。我们发现的罕见变异总实际上有助于疾病的易感性。个人疾病可能是罕见的,但有成千上万的这种疾病和许多更多的定义通过基因组学”Lupski说。
“我希望在几年内,我们将学习的重要性全外显子组测序在成人医学和儿科领域外的发展,”莎朗Plon博士说,贝勒的儿科和分子和人类遗传学教授,主任以及贝勒癌症遗传学诊所和得克萨斯儿童癌症中心的一员。ob体育开户网址“我们正在执行一个NIH-supported临床试验的全外显子组测序在儿童癌症患者学习这些患者的潜在效用。”
详细研究的2000名患者,504例患者接受分子诊断的280例患者有一个单一的基因突变导致疾病(常染色体显性遗传),181人常染色体隐性(两个突变基因),65 X (X染色体突变),另一个是通过线粒体假定继承的。在5例,病人遗传突变基因的两个副本相同的父(单系二体性)。显性突变,208新创突变不是继承自父母,32继承和40不确定,因为父母的样本不能用于实验室分析。
新创的突变,5演示了镶嵌性,这表明突变发生受精后。镶嵌性意味着病人已经有一个小的细胞有不同的遗传模式比大多数的细胞在体内。
研究人员发现708年既定诱发变异等位基因504例,与大多数变异的小说,而不是之前报道。值得注意的是,近30%的研究人员发现的只发生在疾病基因诊断在过去三年。65例,没有可用的基因测试以外的外显子组测序发现变异的基因测试要求。
23例(约5%)在两个不同的基因突变,这可能解释病人的医疗状况的各个方面。
“医生通常试图找到一个诊断,病人可能会解释所有的问题。我们发现,在某些情况下,病人可能有混合表型的两个不同的条件,”英格说。“病人可能有两个不同的罕见遗传疾病来解释他们的条件是一个意想不到的发现之前使用外显子组测序。"
在2000例中,偶然发现医学上可操作的结果,可能导致早期诊断、筛查或治疗92例。三个病人有超过一个发现。
“25%的情况下,收到了分子诊断,这些信息结束了诊断奥德赛,提供更合理的医疗管理和允许精确测定生育风险,但在相对较少的情况下,导致特定治疗逆转的条件,”作者写道。
