研究人员揭示了个体肺肿瘤的基因组多样性
根据今天发表在《科学》杂志上的一篇论文,在局部肺癌中已知的驱动癌症的基因组畸变似乎在肿瘤中始终如一地存在,对肿瘤的一个区域进行活检就可能识别出大部分肿瘤科学。
德克萨斯州大学和德斯逊癌症中心的科学家领导的研究涉及科学家称之为基因组异质性的挑战,这种存在许多不同变异的存在,可驱除肿瘤形成,生长和进展,并且可能使治疗的选择和潜在的疗效复杂化。
一项具有里程碑意义的研究肾细胞癌在2012年发现了最多癌症- 在这些肿瘤的所有区域上不存在突出的变化,因此单个区域的活组织检查不会提供在任何给定肿瘤的成因中重要的癌症基因的良好代表性。
"An important point from our lung cancer study is that tumor heterogeneity will vary between one type of cancer and another. The pattern we found in lung adenocarcinoma is quite different than that in renal cell carcinoma," said study first author Jianjun Zhang, M.D., Ph.D. instructor in Genomic Medicine.
研究人员对11例手术切除的局限性肺腺癌中的48个肿瘤区域进行了全外显子组测序。手术治疗这些非小细胞肺癌有可能治愈。
它们确定了7,269个突变,平均每种突变的76%和21个已知的20%癌症基因在同一肿瘤的所有区域中发现突变。
“这表明在适当深度上测序的单个活组织检查,可以证明是对该组肺癌中已知癌症基因的突变非常有信息,”纸长作者安德鲁Futreal,Ph.D.,基因组医学教授Robert A. Welch的持有者在MD安德森化学中的大学椅子。
与复发的可能联系
肿瘤内的基因组异质性可以作为树结构描绘。躯干代表肿瘤的所有区域存在的突变,分支代表在仅在一个区域中发现的变化的一些区域和更小或“私人”分支中发现的突变。
树干突变,例如20癌基因突变,研究人员在所有地区发现肺肿瘤,早先发生,分支突变在后备箱中发生后突变。
在21个月的中位后,11名患者中的三个复发了。所有三种的分支突变比例较大,40%,限于肿瘤的几个甚至一个区域,而在那些没有复发的人中只有17%的这种突变相比。
张和Futreal小心这些数字太小而无法得出结论;需要更大的研究来确认复发与这些分支突变的负担之间的关系。
“如果这种相关性成立,这意味着这些分支突变的某些方面可能是导致复发的原因,或者是通过替代某些生物学方面。瘤我们尚未识别或随后发生突变,赋予更具侵略性的特征,或者两者的某种组合,“Futreal说。
该团队正处于推出较大的研究重点在早期阶段肺腺癌研究分支机构之间的关联突变以及术后复发,张说。研究结果将有助于对那些复发风险较高的患者进行分层,并进行术后药物治疗以防止复发的临床试验。早期护理标准肺癌单独的手术,复发率为30%至50%。
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