未被怀疑的基因在结肠直肠癌和子宫内膜癌中经常发生突变
科学家们表示,他们已经在大约20%的结直肠癌和子宫内膜癌中发现了一种基因突变,而这种基因突变在最近的大规模、全面的基因搜索中一直被忽视。随着这一发现,被称为RNF43的改变基因现在成为两种癌症中最常见的突变之一。
报道于2014年10月26日自然遗传学美国达纳法伯癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute)、麻省理工学院(Broad Institute of MIT)和哈佛大学(Harvard)的布罗德研究所(Broad Institute)的研究人员表示,这种突变基因有助于控制一种重要的细胞信号通路Wnt,该通路与多种癌症都有关联。他们认为,RNF43突变可以作为一种生物标志物,识别结肠直肠癌和子宫内膜癌患者,这些患者可以受益于靶向Wnt通路的精确抗癌药物,尽管目前还没有此类药物。
“肿瘤突变可能会告诉我们,他们依赖于Wnt信号通路,他们将独特的敏感药物,抑制这个途径,”查尔斯·福克斯说,医学博士,英里,该论文的作者之一,中心主任胃肠丹纳-法伯癌症。他还隶属于布里格姆妇女医院和哈佛大学公共卫生学院。
在癌症的动物模型中,已经发现患有RNF43突变的肿瘤对现在在人类的临床试验中的新WNT途径抑制剂敏感,根据达娜巴斯,博士,博士,博士,兼任达娜巴斯博士,也是广泛研究所的博士后研究员。
研究人员惊讶地发现RNF43基因突变在结直肠和结肠中所占的比例如此之高子宫内膜癌因为在癌症基因组图谱(TGCA)项目的科学家最近进行的肿瘤DNA综合搜索中没有发现它们。
这项新研究的作者认为,TCGA用于分析肿瘤DNA测序数据的计算机算法可能已经将RNF45突变的“信号”解读为一种伪物,并将其丢弃,就像合法的电子邮件有时会被困在垃圾过滤器中一样。
Eran Hodis解释说:“这些突变发生在基因组的重复区域,你在DNA测序中经常会出现错误,所以算法可能更倾向于认为RNF43突变是测序过程中的人为因素。”她是哈佛医学院和麻省理工学院的医学博士/博士生,也隶属于布罗德和丹娜法伯学院。Giannakis和Hodis是这份新报告的共同第一作者。
在结直肠癌中,其他经常发生突变的基因包括APC(73%)、P53(50%)和KRAS(40%)。
RNF45突变的新证据首先来自肿瘤样本的分析从两个大的结直肠癌群组研究——护士健康研究,自1976年以来一直在121000岁的健康女性,和卫生专业人员随访研究,其中包括52000人在1986年入学。大约10年前,Fuchs和Dana-Farber病理学家Shugi Ogino(医学博士,医学博士,医学硕士)一起开始收集和研究胃肠道肿瘤样本,这些样本取自研究中患癌症的男性和女性。由于这些样本附有关于患者生活方式、病史和其他因素的丰富数据,Fuchs称这些肿瘤样本的收集为“一座金矿”。
在这项新的研究中,在dr . Levi Garraway的领导下,在Broad研究所对185个结直肠癌标本进行了全外子组DNA测序分析,Levi Garraway隶属于Dana-Farber, the Broad, and Brigham and Women's Hospital,他是该报告的通讯作者。18.9%的结直肠肿瘤中发现了RNF43突变。
这个令人惊讶的结果促使研究人员重新分析222结肠直肠癌在TCGA项目的样本中发现了17.6%的RNF43突变。研究人员注意到子宫内膜癌依赖于异常的Wnt信号,然后重新分析了TCGA科学家之前分析过的248份子宫内膜癌DNA样本。他们发现RNF43的比例惊人地相似——18.1%突变在这些癌症。科学家们预测,他们也将在胃癌中发现这种由异常Wnt信号驱动的突变。
该研究作者指出,这一发现意义重大癌症在以前的基因狩猎中未被拾取的突变表明,执行这些综合基因组搜索的持续有价值。
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