人类偶联的最大地图预测新的癌症基因

科学家们绘制了迄今为止规模最大的人类基因组编码的蛋白质与新预测的几十个与癌症有关的基因之间的直接相互作用图。

新的“人类互联蛋白酶”图描述了蛋白质之间的约14,000个直接相互作用。互乱组是由蛋白质和“粘在一起的其他细胞成分形成的网络。新地图比以前的任何一种地图大于四倍，含有比以前所有的研究所做的所有研究更高的互动。

CiFar高级同伴Frederick Roth，以及Marc Vidal（Dana-Farber Cancer Institute和Harvard Medical School）联合领导了国际研究团队，它在11月20日撰写细胞。罗斯是山上山上伦敦赛腾仓库山研究所的高级调查员，并在多伦多大学唐纳利唐纳里和生物分子研究中心教授。他也是加拿大卓越的综合生物学研究椅。

使用实验室实验，科学家识别交互，然后使用计算机建模，它们放大了“连接”到一个或多个其他的蛋白质癌症蛋白质。

“我们真的首次展示，即癌症蛋白更可能彼此相互连接，而不是通过连接到随机选择的非癌症蛋白质，”罗斯说。

“一旦看到与同一疾病相关的蛋白质更有可能相互连接，现在您可以使用这种相互作用作为预测工具来寻找新的癌症蛋白质，以及它们编码的基因”，“罗斯说。例如，两种已知的癌症基因编码了两种与CTBP2相互作用的蛋白质，蛋白质编码在绑定到的位置前列腺癌，它会扩散到附近的淋巴结。这两种蛋白质与淋巴肿瘤有关，这表明CTBP2在淋巴肿瘤的发展中起着作用。

通过他们的预测方法，研究人员发现60个他们预测的癌症基因符合一个已知的癌症途径。

像这样的发现对于理解癌症和其他疾病是如何发展的以及最终如何治疗和预防它们至关重要。人体中绝大多数蛋白质的相互作用是一个谜。罗斯把被要求治疗病人疾病的医生比作汽车修理工。

“我们怎样才能要求某人用不完整的零件清单来修复一辆汽车，没有关于零件如何合适的指导？”他说。

每个基因都可以编码多个部分，研究人员正在努力全面了解所有这些部分，它们在我们身体的细胞内发现，以及它们如何相互连接。面包师酵母的研究在基因组规模上映射了相互作用，但新的研究是第一个在人类中接近这种规模的研究。

研究还揭示了蛋白质人类之间的相互作用涵盖的基因范围比过去的一些研究认为的要广泛得多。罗斯说，研究往往只关注那些已知与疾病有关的“流行”蛋白质，或者因为其他原因而变得有趣的蛋白质，这让我们在理解相互作用时产生了偏见。

“论文的一个主要结论是，当你系统地看待互动时，你会发现它们到处都是，”他说。

Roth说，这项研究是CIFAR基因网络项目目标的核心，特别是建立一个生物体的基因型，即它的一组基因，如何与生物体的表现型相联系的地图，它的特征包括外观和疾病易感体质。的知识互动很可能会通知全世界的努力来序列和解释癌症基因组。

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