研究小组在肺癌中发现了新的基因异常
开发有效的肺癌治疗方法一直是一项挑战,部分原因是如此多的基因突变在这种疾病中发挥了作用。
通过分析肺癌的DNA和RNA,密歇根大学综合癌症中心的研究人员发现病人肿瘤中含有大量基因融合的患者比基因融合较少的患者预后更差。基因融合是癌症中发现的一种基因异常,当基因重新排列并融合在一起时发生。
此外,研究人员还发现了一些发生在肺癌(包括有吸烟史的患者)中的新的基因异常。
“肺癌是一种复杂的疾病,有很多原因。我们的深度测序分析在肺癌中发现了新的基因融合,而大多数已知的融合都是阴性的。这些新的异常可能成为开发新治疗方法的目标,”研究作者Arul Chinnaiyan说,他是医学博士、博士,密歇根大学医学院转化病理学中心主任和S.P. Hicks病理学教授。
这项研究观察了753个肺癌样本,包括吸烟者和非吸烟者。前153份样本来自密歇根大学,并与《癌症基因组图谱》(The Cancer Genome Atlas)发表的一份报告中的521份样本进行了结合。
研究人员发现了6348种不同的融合,平均每个肿瘤样本有13种融合。两种基因途径的异常最为普遍:Hippo途径和NRG1途径,前者以前被认为与一些罕见的癌症有关,后者以前从未在癌症中发现过。
这项研究发表在自然通讯。
研究人员知道,三种常见的基因融合——包括ALK、RET和ROS——在大约5%的肺癌中起作用,但主要是在非吸烟者中。这种新的异常仅在没有ALK、RET或ROS融合的患者中发现。
“我们的结果表明,在与吸烟有关的更复杂的基因组中,基因融合事件似乎是频繁的,”研究作者大卫·g·比尔博士说,密歇根大学医学院胸外科和放射肿瘤学教授,密歇根大学综合癌症中心癌症遗传学联席主任。
制药公司已经在研究针对Hippo通路和NRG1的药物。研究小组建议探索这些抑制剂作为肺癌的潜在治疗手段。
此外,基因融合的数量与预后有关的发现表明,可以开发一种筛查技术,帮助医生确定患者的肿瘤可能有多大的侵袭性,并据此量身定制治疗。
该研究确定了许多不同的基因融合,这些融合构成了肺癌的景观,其中大多数只发生在少数单个肿瘤样本中。3%的患者出现Hippo通路融合,4%的患者出现NRG1融合。研究人员建议扩大肺癌基于这些分子特征的亚型。
“我们之前在靶向治疗低复发基因融合方面取得了成功。像这样的大规模基因组分析使我们能够确定每个患者肿瘤的更多关键驱动因素,以便我们能够匹配最合适的治疗方法,”Chinnaiyan说。
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