研究人员打开“潘多拉的盒子”潜在的癌症生物标志物

一个新的分析将打开大门以发现数千次潜在的新癌症生物标志物。

密歇根大学的研究人员综合癌症中心分析了一部分基因组的全球景观，这些内容尚未熟悉探索 - 长期非编码RNA。这种大部分人类基因组被认为是暗物质，因为这对它知之甚少。新的新证据表明，LNCRNA可能在癌症中发挥作用，更好地了解它们可能导致新的潜在的改进目标癌症诊断，预后或治疗。

“我们知道关于蛋白质编码基因，但这仅代表了1-2％的基因组。关于非编码的生物学是众所周知的更少基因组in terms of how it might function in a human disease like cancer," says senior study author Arul M. Chinnaiyan, M.D., Ph.D., director of the Michigan Center for Translational Pathology and S.P. Hicks Professor of Pathology at the University of Michigan Medical School.

研究人员将25个独立的数据集拉到一起，总计7,256个RNA测序样品。这些数据来自公共来源，如癌症基因组目标，以及来自密歇根州的翻译病理档案馆。它们施加了高通量RNA测序技术，以识别正常组织的58,000多种基因和一系列常见的癌症类型。

研究结果显示在线自然遗传学。

“我们利用所有这些数据来破译基因组景观在不同组织中以及癌症中的内容，”Chinnaiyan说。“这开辟了一个潘多拉的各种LNCRNA盒来调查生物标志物潜力。”

在公共网站上提供了名为MITRASSCRESSOME纲要的完整数据集，http://www.mitranscriptome.org.，为科学界探索。

研究人员还确定了一种LNCRNA，Schlap1，作为潜在的生物标志物，用于侵袭性前列腺癌。Schlap1更高度表达转移性前列腺癌比早期疾病。Schlap1主要被发现在前列腺癌细胞不在其他癌症或正常细胞中，这使研究人员能够开发出非侵入性测试来检测Schlap1。这种测试可用于帮助患者，他们的医生为早期进行治疗决策前列腺癌。

“一些长期的非编码RNA往往是特定的癌症，而蛋白质编码基因通常不是。这就是使LNCRNA成为发展生物标志物的有希望的目标，“Chinnaiyan说。”我们希望研究人员能够调查丙种型胶质组件并开始提名LNCRNA进行进一步的研究和发展。这可能只有这些的子集具有真正的功能，而是作为以前未开发的区域，它具有很大的承诺。“

---

---