转录组识别基因和信号通路,调节神经退化
神经元死亡是大脑发育的正常特性也神经退行性疾病的一个定义特征时不当管制。详细和全面的分析转录组表达的改变在神经元死亡的报告。大量的神经元死亡有关的基因以前不是识别研究中。虽然还需要进一步的功能分析,这些基因可能是重要的球员调节神经元死亡和代表潜在的目标发展的新的治疗方法。
大规模消除神经元是神经系统的正常发展的一个关键方面,也代表一个定义特征的神经退行性疾病,如阿尔茨海默氏症、帕金森病、亨廷顿病和肌萎缩性脊髓侧索硬化症。尽管分子事件,引发这些神经元死亡神经退行性疾病是截然不同的,下游凋亡过程神经元死于这些疾病被认为分享彼此的共同点,以及developmentally-regulated神经元死亡。识别基因促进或阻止神经元死亡将因此成为一个重要的步骤在理解developmentally-regulated神经元死亡以及机制大脑退行性疾病。南卫理公会大学的科学家,由生物科学的教授和主席桑托什D 'Mello,使用RNA-Seq进行转录组分析死亡神经元基因表达的变化。
这项研究中,在2015年2月出版的报告实验生物学和医学,利用培养的小脑颗粒神经元,使用最广泛的模型之一来研究神经元死亡。其他实验室使用DNA微阵列分析描述基因表达的变化在这个模型中。然而,微阵列分析仅仅是能够测量已知的状态记录,和low-abundance mrna的表达通常不是hybridization-based检测到的方法。在几百个基因的表达变化检测到微阵列分析,在D 'Mello及其同事的研究显示4000个基因表达而发生明显改变。影响最大的是基因在细胞死亡和生存的监管功能,细胞生长和增殖和分子运输。大量的基因在神经系统发育和功能也被解除。
分析影响的信号通路指出线粒体功能和氧化磷酸化的变化,符合许多研究显示出这些通路的扰动在神经退行性疾病。大量的基因以前不是与developmentally-regulated神经元死亡或神经退行性疾病中被确认。“这是一个识别的第一步小说但重要的球员调节神经元生存和死亡”D 'Mello博士说。这部小说“未来的研究将确定在多大程度上被确定的基因在我们的研究中参与调节神经元死亡,包括死亡与神经退行性疾病有关。”
史蒂芬·r·古德曼博士主编实验生物学和医学说:“D 'Mello和他的同事们进行了转录组研究中,利用RNA-Seq,识别记录,改变了表达在神经元死亡。利用这种技术非常敏感的他们能够证明在超过4000个基因的表达显著变化。本研究打开了一扇通往未来的研究,许多基因都是功能正常神经元死亡这与各种神经退行性疾病有关。
