2015年7月9日

在精密处理中研究肿瘤基因组测序和DNA的血液试验的研究进展

在101例胰腺癌和血液的基因组排序研究中，约翰霍普金斯金梅尔癌症中心科学家表示，他们发现至少有三分之一的患者的肿瘤有可能有一天有一天有节点帮助指导其疾病的精确治疗。他们说，血液检测结果检测肿瘤的DNA脱落，还预测了癌症复发超过标准成像方法的一年以上。

“胰腺癌具有癌症类型的最高死亡率之一。许多人认为没有治疗方案，但我们的研究表明，患者肿瘤样本的基因组测序可以识别突变医学博士、博士Victor Velculescu说，他是约翰霍普金斯大学医学院的肿瘤学和病理学教授，也是Kimmel癌症中心癌症生物学项目的联合主任。

Velculescu警告说，要让患者意识到基因组测序在指导治疗方面的好处，研究人员首先需要开发更大的、多机构的试验，使用实验性或已获批准的药物，针对由约翰霍普金斯大学领导的团队确定的突变。目前,胰腺癌接受手术治疗，放射治疗和化疗。

他们的测序研究结果，使用由Johns Hopkins研究人员共同创立的个人Genome Diagnostics Inc.产生的数据，于7月7日在线发布自然通讯。

胰腺癌在美国近50,000人中被诊断出来。在过去的诊断超过五年中，他们少于10％以上，大多数患者都是根据疾病阶段的疗法，而不是其癌症的基因组质量。

对于测序研究，Velculescu和他的同事收集了来自101例胰腺癌患者的肿瘤样本和正常DNA，其肿瘤在宾夕法尼亚大学，哥本哈根大学和华盛顿大学在圣路易斯举行的肿瘤上被移除。

该团队排序101例患者肿瘤和正常DNA中的24个基因组的整个展开，或基因组的编码区域，以发现患有癌症的生长的基因，并且在该组中常常突变。然后，在患者的其余部分中测序肿瘤和正常DNA，特别是在癌症促进基因的子集中寻找突变。

合著者Mark Sausen博士说，胰腺癌组织通常很难测序，突变也很难发现。研究完成时，他曾是Velculescu实验室的研究生，现在受雇于Personal Genome Diagnostics Inc.。为了克服这一问题，该团队使用了敏感的“深度测序”方法，对每个核苷酸碱基进行了超过750次的分析，以确定突变基因。

该团队报告称，101名患者中有98名已知的胰腺癌基因，TP53和KRA具有肿瘤突变。到目前为止，萨森说，针对这两个突变的药物令人失望的结果。然而，该研究确定了38名患有基因突变的患者，如ErbB2，Pi3KCA，BRCA2，AKT1和AKT2，这是已经批准的其他疾病或正在进行或公布的临床试验的药物的重点。

Velculescu表示，他以约翰霍普金斯科学家们所发表的研究提供了潜在价值的药物疗法精确选择的潜在价值证明，以便他们解决特定癌症突变的能力。它们用胰腺癌患者的肿瘤测序，发现PALB2基因中的突变，参与修复DNA损伤。当医生用丝霉素C治疗患者的患者，DNA破坏药物，患者在过去的诊断中超过五年的诊断，超越平均存活估计数。

在新的测序研究中发现的突变基因中，有一些与染色质调控相关的基因，染色质调控是一个指导DNA如何展开自身小片段，从而让酶激活基因的过程。在目前的测序研究中，有20名患者(20%)的ARID1A或MLL染色素调节基因突变，并接受常规治疗，其总体生存率是没有突变的患者的两倍。11例MLL基因突变的患者在32个月后仍存活，而MLL基因正常的患者存活了15个月。

在进一步的实验中，科学家从51名胰腺癌-44患者中每三个月收集血液样本，其中101名受试者在目前的研究中决七名额外的患者 - 长达三年。在诊断时，51（43％）中的其他约22例在血液中具有可检测的癌症DNA水平。此外，与标准成像相比，科学家们在六个月之前预测患者的癌症复发六个月，与标准成像相比。

Velculescu说:“我们越早发现复发，我们就能越早使用其他疗法进行干预。”“利用血液样本进行液体活检的研究正在发展，但这些初步结果为开发残留疾病早期检测和实时监测的方法提供了希望。耐心癌症。”