与肺癌进展相关的基因多态性
与癌症进展相关的基因多态性导致基因表达的变化,并可能作为肺癌的预后标志物。广岛大学和埼玉医科大学的研究人员发现,在肺癌患者中,一种单核苷酸多态性(SNP)可能调节基因和蛋白质表达,并与不良预后相关。为了将这种基因多态性作为一种有用的临床预后标志物,并进一步阐明其分子机制,需要对肺癌和/或其他类型的癌症进行大规模的临床病理研究。
缺氧诱导因子-2 α (HIF-2 α或EPAS1)是重要的癌症恶化,它的过表达被认为是一个假定的生物标志物预后不良在肺癌患者中。然而,EPAS1过表达的分子机制尚未完全了解。最近,有报道称EPAS1的几个snp与包括癌症在内的各种疾病的发展有关。
广岛大学的Keiji Tanimoto博士和他的合作者专注于EPAS1中的snp。他们通过生物信息学分析,研究了这些SNPs在EPAS1基因表达调控中的作用以及这些SNPs与肺癌患者预后的关系。
“EPAS1的几个SNPs已经被证明与各种疾病相关,但它们的机制几乎不为人所知,”Tanimoto博士说。他继续说,“EPAS1内含子1区域内的SNP可能影响EPAS1基因和蛋白质的表达,EPAS1的A(腺嘌呤)等位基因而不是G(鸟嘌呤)等位基因与预后不良有关肺癌患者。"
研究评估了EPAS1区域内的SNP与肺癌患者总生存期的相关性。携带至少一个A等位基因的患者的中位生存时间明显短于携带G等位基因的患者(28.0个月vs. 52.5个月)。
具有EPAS1等位基因A的癌细胞在体外实验中EPAS1基因和蛋白表达均较高。提示EPAS1的A等位基因通过调控EPAS1基因和EPAS1基因在肺癌进展中起重要作用蛋白表达。
“除了肺癌,其他癌症,如结肠直肠癌和头颈部癌也被报道有与EPAS1过表达相关的不良预后。在未来通过大规模研究证实我们的观察后,EPAS1 SNP基因分型可能成为个性化健康检查和癌症治疗的临床有用工具。”Tanimoto博士解释道。
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