TCGA的发现为第二常见的肾癌提供了分子背景

美国国立卫生研究院资助的癌症基因组图谱(TCGA)项目的科学家已经对第二常见肾癌的两种类型进行了分子特征分析，并对该疾病的几个亚型进行了分类。

乳头状肾细胞癌(PRCC)占肾脏的15 ~ 20%癌症每年确诊病例。长期以来，它一直被归类为1型或2型，但直到现在，科学家们对PRCC潜在遗传学的大部分了解都是基于从罕见的遗传性疾病中收集的信息。对于没有家族病史的病例的分子背景知之甚少肾癌．目前，没有有效的治疗晚期PRCC的方法。

研究结果描述了1型和2型之间的特定分子差异，以及2型的三个亚型今天公布的在新英格兰医学杂志．

“乳头状肾细胞癌对临床医生来说是一个特别的问题——在一些患者中，这种疾病仍然是惰性的，但在肾脏中广泛存在。在其他情况下，单个病变可能具有高度侵袭性，”Van Andel研究所(VARI)的助理教授Shen Hui博士说，他为TCGA研究网络的一部分研究进行了关键的生物信息学工作。“这些发现不仅为医生提供了临床决策所需的急需信息，还为开发靶向疗法更好地治疗这种疾病的特定亚型奠定了基础。”

分类癌症

研究人员对161名患者的肿瘤进行了彻底的基因组分析，发现1型和2型PRCC在分子和基因组上是不同的，应该被视为两种不同的疾病。他们还发现了2型糖尿病的三种不同亚型，每一种亚型的特征都是不同的分子变化。

其中一种2型亚型的特征是基因组中数千个基因的DNA甲基化或高甲基化的增加。DNA甲基化是对DNA分子的一种修饰，它控制着基因的开启或关闭，如果甲基化出错，就会导致肿瘤的发生。这种2型PRCC的新亚型——CpG岛甲基化表型(CIMP)——在所有PRCC类型中总生存率最低，并且与参与新陈代谢的基因的改变密切相关。这些变化导致CIMP肿瘤细胞发生代谢转移，从而支持其快速生长和存活。

“带有CIMP的样本与PRCC发病的早期相关，并且是最致命的，”沈说。“使用分子标记进一步区分CIMP等亚型的能力，为科学家和临床医生提供了更准确地诊断癌症类型以及针对患者特定癌症制定治疗策略的强大工具。”

该研究还描述了几种已知的癌症相关遗传途径的改变，包括MET/VEGRF和NRF2/ARE。针对MET/VEGRF的药物目前正在PRCC的临床试验中，针对NRF2/ are的靶向疗法最近已经开发出来。

大规模的努力

TCGA由NIH国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI)运营，旨在全面描述预后不良和对公共健康有重大影响的癌症。TCGA研究网络由来自美国各地的研究和医疗机构的研究人员组成，其中包括沈晓东;Peter Laird博士，VARI教授，作为研究网络的一部分，他领导了甲基化研究数据的收集;以及医学博士、VARI教授、约翰霍普金斯大学Sidney Kimmel综合癌症中心癌症生物学联合负责人Stephen Baylin，他也是PRCC论文的作者之一。他们加入了来自41个参与PRCC工作的组织的调查人员。

今天的出版物是TCGA努力发表的一系列高影响力论文中最新的一篇。上个月，该小组发表了一份关于侵袭性小叶乳腺癌的综合分析报告。今天，一篇描述前列腺癌基因组背景的论文也发表在该杂志上细胞．

“TCGA对癌症研究的影响是不可估量的，”莱尔德说。“它展示了数百名科学家之间的大规模合作如何能结出果实，并产生真实、有形的结果。TCGA的数据是公开的——它使该领域的每个人都受益，也使那些将从使用这些信息开发的疗法中受益的患者受益。”