研究发现在12种癌症类型中遗传遗传易感性
研究人员渴望众所周知,发展癌症的某些情况是遗传性,并且遗传遗传误差在一些肿瘤中非常重要,但在其他肿瘤中如此少得多。
在一个新的分析中,研究人员在这些遗传因素上阐明了12个癌症类型 - 显示胃癌的令人惊讶的遗传组分,并在众所周知的乳房中的某些类型突变的后果提供一些所需的清晰度癌症易感基因,brca1和brca2。
从华盛顿大学医学院在圣路易斯医学院的研究中出现了12月22日自然通信。
调查人员分析了来自癌症基因组Atlas项目中包含的4,000多个癌症病例的遗传信息,由国家卫生研究院(NIH)资助的一项倡议来解开癌症的遗传基础。
“一般来说,我们已知卵巢和乳腺癌具有显着的遗传群,其他人如急性髓性白血病和肺癌,具有更小的遗传遗传贡献,”李德平,博士,副教授华盛顿大学McDonnell基因组研究所医学和助理主任。“但这是一项大规模的第一次,我们已经能够确定基因罪魁祸首或甚至负责癌症易感性的实际突变。”
新信息对提高现有遗传测试的准确性有影响癌症风险并最终扩展可用的测试,包括更广泛的肿瘤。
过去的癌症基因组研究与患者健康组织和同一患者肿瘤的测序数据相比。这些研究发现肿瘤中存在的突变,帮助研究人员确定可能在癌症中发挥作用的重要基因。但这种分析不能区分出生时存在的遗传突变和在寿命上获得的突变。
为了帮助梳理癌症的遗传成分,新的研究会增加含有“种系”信息的患者正常细胞的测序数据。患者的种系是父母遗传的遗传信息。这种新的信息层给出了患者基因的遗传基线在出生时,可以揭示是否癌症相关的突变已经存在。
在他们分析的所有癌症病例中,调查人员寻找已知与癌症相关的基因中的罕见种系突变。如果在出生时已经突变了一个父母之一的一个这些基因的副本,则来自另一个父母的第二正常拷贝通常可以补偿缺陷。但具有这种突变的个体更容易受到所谓的“第二次击中”。随着年龄的增长,它们处于剩余的基因正常拷贝中发育突变的风险较高。
“我们寻找肿瘤中的种质突变,”丁说。“但是对于突变而言,这是不够的;他们需要在较高频率上富集肿瘤存在。如果突变存在于肿瘤中并在肿瘤中扩增,则会有很高的可能性在癌症中的作用。“
在114个已知与癌症相关的基因中,它们在所有12种癌症类型中发现了罕见的种系突变,但根据类型的不同频率。他们专注于一种称为截断的突变,因为大多数截短的基因根本不能起作用。
在卵巢癌病例中,研究人员的研究,其中19%是罕见的种系截断。相比之下,只有4%急性髓性白血病分析中的病例在系列中携带这些截断。他们还发现,11%的胃癌病例包括这样的种系截断,这是一项令人惊讶的是,根据研究人员,这是一个惊喜,因为该号码与乳腺癌的百分比有关。
“我们还发现,除乳腺癌之外的肿瘤类型中存在的BRCA1和BRCA2基因中的大量种系截短,例如,例如,丁说。”“这表明我们应该注意这两种基因在其他癌症类型中的潜在参与。”
BRCA1和BRCA2基因对于DNA修复很重要。虽然它们主要与乳腺癌的风险相关,但这种分析支持越来越多的证据,即他们具有更广泛的影响。
“患有BRCA1截断的诱发毒性,90%的BRCA1在肿瘤中致染色,无论癌症类型如何,”丁说。
BRCA1和BRCA2基因的遗传检测患者患有乳腺癌的风险可以揭示预防的极其有用的信息。例如,当基因显示正常时,乳腺癌的遗传风险没有升高。但是,如果这些基因中的任何一种以已知禁用基因的方式突变,乳腺癌风险大幅增加。在这种情况下,医生和遗传辅导员可以帮助女性驾驭可用于减少风险的选项。
但突变有很多品种。遗传测试也可以揭示许多对这些功能有未知后果的基因,因此无法预测它们对癌症风险的影响。
为了帮助临床实践中的这个灰色区域,丁和她的同事杰弗里帕尔文,MD,博士,俄亥俄州州立大学的计算生物学和生物信息学司教授和总监,冯辰,博士,华盛顿医学副教授大学,研究了BRCA1基因未知意义的68个种系无截断突变。对于每种突变,他们测试了BRCA1蛋白可以进行其关键DNA修复功能之一的程度。研究人员发现,六个突变表现得像截断,完全禁用该基因。这些突变也富集在肿瘤中,支持癌症中的可能作用。
“重要的是要表明这六个未知的临床意义的突变实际上是功能丧失突变,”丁说。“但我也想强调对比点。至少更多地显示正常功能,至少根据我们的分析。许多这些类型的突变是中立的,我们想识别它们,使保健提供者能够更好地劝告他们的耐心。”
丁说需要更多的研究来确认这些结果,然后才能建议患者进行保健决策。
“我们调查种系肿瘤互动的策略为优先顺序提供了重要的方式突变我们应该专注于,“她说。”对于最终用于诊所的信息,我们需要对甚至更大的患者进行这种类型的分析。“
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