2016年3月21日报告
FOXA1控制癌细胞的特异性
梅欧宝娱乐地址奥诊所的一组研究人员已经了解了更多关于一种被称为FOXA1的转录因子如何形成癌症特异性基因组标识符，以及它如何在四种非常不同的人类癌细胞系中以不同的方式调节基因表达。他们的论文发表在杂志上科学的进步，该团队描述了如何使用基因编辑技术和其他工具来了解有关允许蛋白质在不同类型癌症中调节基因表达的独特结合过程的更多信息。
科学家们知道癌症不会孤立地生长，肿瘤，如身体的其他部位由依赖相同的生物过程，以调节作为其他组织或器官的子组织。其中一种方法是转录调节，其中细胞调节DNA序列的转化为RNA。在这种新的努力中，研究人员看着蛋白质编码基因Foxa1，其与若干类型的人类癌症有关。更具体地说，他们研究了一个转录因子能够为不同类型的细胞形成癌症特异性基因组变化，因为在试图了解肿瘤的生长和迄今为止，它仍然没有很好地了解。
研究人员始于一种类型的测序技术，允许加工大量基因组，这使得它们能够看到FoxA1如何在两种不同种类的乳房中针对基因癌症细胞以及肝脏和前列腺癌细胞——这让他们看到了以前未知的蛋白质特征;量身定制的定位和结合DNA。然后，该团队使用CRISPR- Cas9基因组编辑技术进行了更深入的研究，发现细胞特异性的FOXA1调控是由于独特的结合、遗传变异和/或可能的非遗传调控，这增加了FOXA1控制特定类型癌细胞发展过程的更多证据。
在分析了他们的工作之后，该团队提出了一个假设来描述他们认为这一过程是如何工作的，将其描述为一个看起来很像花朵绽放时发生的过程。它们暗示着肯定的“盛开”转录因子可能由其基因变异的独特性、其独特的结合能力以及可能包括其他调节因子和/或染色质重构的其他一些可能因素来管理。最终的结果是更多关于癌细胞生长背后的机制的信息，这增加了不断增长的数据体，可能有一天会揭示控制这种生长的方法，从而防止癌症造成伤害。
摘要
转录因子在多个小区类型中差差和/或相同。然而，对转录因子的细胞特异性调节的机制仍有待阐明。我们解决了单次转录因子，转录箱蛋白A1（FOXA1），形成细胞特异性基因组特征并差异地调节四种人类癌细胞系中的基因表达（HepG2，LNCAP，MCF7和T47D）。Foxa1是有机组织和癌症进展中的先驱转录因子。染色质免疫沉淀序列的FoxA1的Genomewide映射注释与FoxA1结合相关的靶基因大多是这些癌细胞的常见。然而，大多数功能性FOXA1靶基因对每个癌细胞类型特异。使用CRISPR-CAS9基因组编辑技术的进一步调查表明细胞特异性FOXA1调节可归因于独特的FOXA1结合，遗传变异和/或潜在的表观遗传调节。因此，FOXA1控制癌细胞类型的特异性。基于这些观察结果，我们提高了“花朵盛开”假设进行细胞特异性转录调节。
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