结直肠癌的基因组组成预测免疫系统对抗肿瘤的能力

丹娜-法伯癌症研究所、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的研究人员在一项新研究中报告说，结直肠癌大量包裹着被称为新抗原的肿瘤相关蛋白质，很可能充满了抗疾病的白细胞。因为白血球的大量涌入通常意味着免疫系统对癌症的攻击，这一发现将促进对治疗方法的研究，使肿瘤更容易受到这种攻击。

这一发现发表在今天的杂志上细胞的报道．它是通过结合两项大型健康跟踪研究(护士健康研究和卫生专业人员随访研究)中患者的几组数据得出的。研究人员首先对来自619名患者的结直肠肿瘤样本进行了全外显子组测序，逐条列出了DNA的每个字母，这些字母指明了细胞蛋白质的构建方式。该信息与来自测试的数据合并免疫系统对肿瘤的反应以及患者的临床数据，包括生存时间。

“我们正在寻找基因特征，以预测肿瘤被淋巴细胞浸润的范围白细胞以及存在哪种类型的淋巴细胞，”该研究的共同主要作者、医学博士、达纳-法伯胃肠道癌症治疗中心的医学肿瘤学家和临床研究员、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的研究员Marios Giannakis说。“我们发现，具有高‘新抗原负荷’的肿瘤——携带大量新抗原——倾向于被大量淋巴细胞浸润，包括记忆T细胞，这些淋巴细胞为以前遇到的感染和疾病提供保护。肿瘤中新抗原含量高的患者也比新抗原含量低的患者存活时间更长。”

新抗原是蛋白质抗原的变异形式，存在于正常细胞中。基因突变通常会导致癌症细胞产生异常蛋白质，其中一些会被带到细胞表面，在那里它们作为免疫系统的一个危险信号，表明细胞有问题。

“肿瘤细胞上可能有数百或数千种新抗原，”Giannakis解释道。“其中只有少数可能会真正刺激T细胞浸润肿瘤。但展示的新抗原越多，其中一些引发疾病的几率就越大免疫系统反应．"

被称为免疫检查点抑制剂的疗法通过移除免疫系统攻击癌症的一些障碍来发挥作用。尽管这些药物在某些情况下产生了惊人的效果，但它们通常只对那些免疫系统已经对癌症产生免疫反应的患者有效。通过显示高抗原负载的肿瘤容易被T细胞——因此激起了一个免疫反应这项研究可能有助于研究人员确定哪些患者最有可能在免疫检查点抑制剂的新临床试验中受益。

这项研究对结直肠肿瘤样本的基因组分析还发现了几个经常突变的基因，包括BCL9L、RBM10、CTCF和KLF5，这些基因以前与该疾病没有很强的相关性。发现它们在结肠直肠癌这表明它们可能是新疗法的有价值的目标。

Giannakis说:“我们的研究有助于阐明结直肠癌的整体发展。”“这也表明，通过将分子研究与流行病学和免疫学等其他领域的发现相结合，可以获得深刻的见解。”

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