计算模型在精神分裂症中发现新的蛋白质-蛋白质相互作用

匹兹堡大学医学院的研究人员利用他们开发的计算模型，发现了500多个与精神分裂症相关基因相关的蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)。研究结果今天在网上发表npj精神分裂症这本名为《自然》出版集团(Nature Publishing Group)的杂志可能会让人们对这种精神疾病的生物学基础有更深入的了解，并为治疗指明道路。

已经存在许多基因组 - 宽协会研究（GWAs），其鉴定了与增加的风险相关的基因变体精神分裂症，但在大多数情况下，关于这些蛋白质的知名基因皮特医学院生物医学信息学助理教授、高级研究员Madhavi Ganapathiraju博士说。

“GWAS研究和其他研究努力向我们展示了哪些基因在精神分裂症中可能是相关的，”她说。“我们所做的就是下一步。我们正试图了解这些基因如何彼此相关，这可以向我们展示在疾病中重要的生物途径。”

每个基因产生蛋白质，蛋白质通常在生物过程中相互作用。有关相互作用的伙伴的信息可以阐明尚未研究的基因的作用，揭示与疾病相关的途径和生物学过程，以及它与其他复杂疾病的关系。

Ganapathiraju博士的团队开发了一种计算模型称为高精度蛋白质相互作用预测（HIPPIP）并将其应用于通过GWAS鉴定的精神分裂症连接基因的PPI，以及历史上已知的风险基因。他们发现504未知的PPI，并注意到历史上和通过GWA识别的精神分裂症联系基因几乎没有重叠，而该模型显示它们共享超过100个常见的互动者。

“我们可以推断什么蛋白质可以通过查看它的保留，“Ganapathiraju博士解释说。”例如，如果我知道你有很多玩曲棍球的朋友，那么你也可能意味着你也参与了曲棍球。同样地，如果我们看到未知蛋白质与涉及神经信号传导的多种蛋白质相互作用，例如，未知实体也涉及相同的可能性很高。“

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