团队跟踪潜在致命的起源和传播裂谷热”

使用最新的基因组分析技术,转化基因组学研究院(TGen)的科学家们已发现了可能的起源和传播真菌导致谷发烧,根据今天发表在《华尔街日报》一项研究mBio的首映杂志报道高影响微生物的研究。

跨越200万年的故事,包括冰川作用的影响和动物宿主的史前运动,这项研究对未来跟踪奠定了基础这一潜在的致命dust-bound暴发疾病传播在北美和南美的干旱地区。

裂谷热是一种微观真菌感染引起的球孢子菌属是一种生活在沙漠土壤和通常通过肺部进入人体。每年估计有150000的美国人感染裂谷热,和每年多达500人死亡。

”相结合的全基因组测序和先进的统计分析提供了一个理解可能的祖先和真菌的传播途径,”大卫Engelthaler博士说,TGen病原体基因组学项目和业务主管部门或TGen北,和该研究的主要作者。“paleo-epidemiology这个应用程序不仅可以让我们了解什么时候硅谷热真菌是分布在整个西半球,但也如何。”

“这些数据和分析加强我们的能力进行基因流行病学今天,和给我们一个更好地理解这种疾病的变化分布前进,”保罗Keim博士说,TGen北部,北亚利桑那大学的微生物遗传学和基因组学中心和该研究的资深作者之一。

近60%的感染-其他哺乳动物,尤其是dogs-develop没有明显症状接触谷发烧。

然而一些感染患者发展高度衰弱的症状,如咳嗽、发烧和疲劳。这些症状类似于其他细菌或病毒引起的呼吸道疾病,并且经常导致延误诊断和不恰当的治疗。非常严重的山谷发烧可以用抗真菌药物需要终身治疗,甚至死亡。

索诺兰沙漠山谷热演化

有两种截然不同的种类的真菌球孢子菌属导致裂谷热”:c . posadasii最古老的物种,它起源于亚利桑那州南部和墨西哥北部的索诺兰沙漠;和c .巨细胞,这是物种在加州中央谷,加州南部的部分地区以及墨西哥下加利福尼亚。

使用基因数据来自86年球孢子菌属基因组,研究估计的分析c . posadasii分化,形成亚利桑那州和non-Arizona亚种群,在820000年至200万年前。

亚利桑那州亚型今天是在亚利桑那州中部和南部。在亚利桑那州,TGen研究人员确定了多个不同的遗传组来自图森地区,其中一个还包括所有的凤凰隔离,最大浓度的谷热发生的地方。

该研究的作者还估计,真菌蔓延到墨西哥和德克萨斯多达675000年前,大约527000年前南美,中美洲危地马拉不到190000年前。

c .巨细胞似乎已经偏离了总部的c . posadasii物种之间的365000年和920000年在加利福尼亚州的圣华金河谷中部年前。这是一个内陆海更新世时期,到260万年前。淹没了冰川径流只要700000年前,和的出现c .巨细胞可能是其排水。内华达山脉形成的屏障的形成也起到了一定作用c .巨细胞作为一个单独的物种。

谷热蔓延到新的领域

真菌的地理范围正在扩大。新集群的c .巨细胞已确定在华盛顿州东部,它可能出现在加州。谷还发烧也是发生在阿根廷,巴拉圭,巴西和洪都拉斯。前面这个病原体的传播是在很大程度上归因于主要动物迁移过去几十万年。高度敏感的哺乳动物,除了人类,包括狗和其他犬科动物,啮齿动物,在南美骆驼,犰狳和蝙蝠。最近的扩张到华盛顿的原因仍不确定。

“遗传机制和流行病学这一扩张的后果是未知数,需要更好地理解这些病原体的人口结构和演化历史,”布里奇特巴克博士说,TGen助理教授和头部TGen亚利桑那州北部山谷热研究中心和研究的另一个作者。巴克博士也正面TGen研究狗感染了真菌,叫做谷发烧爪子。

这项研究得出结论,研究结果支持额外的大规模人口水平排序球孢子菌属,尤其是弱势地区,尤其是从索诺拉和墨西哥北部的其他地区,重点是隔离从环境中获得的。