研究人员将正常组织的基因表达模式与乳腺癌预后联系起来

北卡罗莱纳大学莱恩伯格综合癌症中心的研究人员发现,肿瘤周围的乳腺组织可以用来衡量雌激素受体阳性乳腺癌女性未来的生存结果。

在杂志中NPJ乳腺癌,研究人员报告说,他们在正常外观中发现了一种特殊的基因表达模式与雌激素受体阳性阳性患者的妇女的较低的10年生存率相关联

基于这一发现,研究人员相信,他们可以利用基因表达模式(通过基因组测序确定)在正常的邻近组织中预测这种类型乳房患者的生存。这是显着的,因为根据国家癌症研究所的说法,大约70%的乳腺癌是雌激素受体阳性的。

“大多数迄今为止,试图为癌症进展开发预测生物标志物的大多数研究都集中在肿瘤细胞本身上,”这项研究的第一个作者梅丽莎·雷斯特,博士学位,一个UNC Gillings学院的副教授全球公共卫生部流行病学。“这表明肿瘤的微环境中的其他因素在预测预后可能是重要的。”

研究人员认为是乳腺癌肿瘤周围正常出现的组织最全面的遗传和分子分析的研究结果。他们说,大规模的大规模进展,DNA和RNA的序列更快地进行了研究。

在这项研究中,研究人员分析了正常组织的多个基因组特征,包括DNA突变、基因重复拷贝、DNA甲基化、miRNA和基因表达模式。这些样本来自“癌症基因组图谱”(Cancer Genome Atlas),这是一个由联邦研究资金支持的多机构合作项目,旨在绘制导致癌症的基因组和表观基因组改变。

“正常组织没有与肿瘤样本相同的关注,”联合作用的凯瑟琳·赫内德利,博士学位,一个UNC Sceberger成员和Rescopy of Temetics of Genetics医学院UNC学院的研究助理教授。“这种分析允许我们更接近这些正常的组织是否实际上是分子正常的。我们发现的是许多样本,有肿瘤或组织的变化。有趣的是,没有单一基因组分析一致地确定邻近乳房组织中的缺陷,突出难以找到这些改变。“

在采用多种基因组方法检测的样本中,约40%的样本在肿瘤边缘以外的正常组织中存在某种类型的DNA或RNA缺陷。研究人员认为,利用基因组学的方法,他们发现了用显微镜无法检测到的癌细胞或有缺陷的正常细胞。然而,缺陷细胞的存在与患者生存的好坏没有关系。

“乳腺癌研究人员已经认识到,可能的母乳喂养治疗留在部分或完全转化的组织或细胞后面,”厄尔特表示。“但是这些细胞通过手术后的治疗来靶向,使复发率低用于哺乳治疗。”

雷斯特表示,这种发现突出了放射治疗的好处,这已被证明为选择哺乳手术的女性的复发率降低。它还重申研究发现在手术期间没有有益于更广泛的手术边缘 - 因为它们发现遗传缺陷的细胞远离肿瘤的4厘米。

“这表明只需用更宽的边缘消除肿瘤就不足 - 这些突变仍然存在于肿瘤的远距离,”托··斯特斯特说。“这告诉我们,放射治疗和佐剂化疗在消除那些DNA缺陷的细胞方面非常有效。”

他们还分析了肿瘤边缘外正常组织的形态。基于对mRNA和microRNA表达模式的分析,他们在肿瘤附近发现了两种不同的组织亚型。在雌激素受体阳性的女性癌症患者中,其中一种亚型与显著降低的10年生存率有关。

“周围组织的基因表达亚型可能反映了这些患者乳房组织的组成和生物活性,”特罗斯特说。这种亚型与整体生存率较差有关的人,其组织中可能有更多的脂肪,或有更高的致癌信号。

这表明有可能从微环境的标准临床信息来预测患者的预后,”特罗斯特说。


进一步探索

多路复用免疫荧光显示乳腺癌中的蛋白质表达改变

更多信息:李慧等。MRI定量组学在TCGA/TCIA数据集中预测乳腺癌亚型分子分类中的应用npj乳腺癌(2016)。DOI: 10.1038 / npjbcancer.2016.12
引文:研究人员将正常组织的基因表达模式链接到乳腺癌预后(2016年5月27日)从//www.puressens.com/news/2016-05-link-gene-patterns-tissue-brest.html中检索到乳腺癌预后(2016年5月27日)
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