基因组数据共享中可用数据的显著扩展

基因组数据共享中可用数据的显著扩展
鼓励研究人员提交他们的数据。GDC将协调所有传入的数据。来源:美国国家癌症研究所

近日,美国国家癌症研究所(NCI)和基金会医学公司(FMI)签署了一项数据共享协议,这将大大提高基因组数据共享(GDC)的能源和资源利用率。一家分子信息公司,已经生成了癌症患者的基因组档案。NCI的GDC是一个统一的数据系统,它促进了研究者之间基因组和临床数据的共享,是Cancer Moonshot和总统的精确医学计划的核心组成部分。NCI是国家卫生研究院的一部分。

扩大的数量GDC的病例将允许研究人员识别导致个别患者肿瘤癌变的基因组变化,并确定哪些药物可能阻止这些突变的影响。这种靶向药物可以缓解某些患者的症状。

当GDC于本月初启动时,它能够立即利用几个大型NCI项目中存在的基因组数据,如癌症基因组图谱(TCGA)和儿童项目,治疗应用研究产生有效治疗(TARGET)。TCGA和TARGET是世界上规模最大、最全面的癌症基因组数据集,收集了约14500名患者的信息。

这项名为FoundationOne(注册商标)的研究将为GDC提供一个巨大的推动。这项研究来自于18000名不同类型癌症成年患者的基因组分析数据。FMI开发了FoundationOne作为一种商用测试,它使用先进的测序技术对癌症样本进行常规分析。

NCI代理主任Douglas Lowy医学博士说:“GDC的这一重大数据注入将大大提高我们使用该工具探索癌症基因异常的能力。”“通过TCGA和目标,我们已经建立了一个强大的癌症基因组基础推出的环球数码创意,但从FMI之外的基因组数据,我们相信环球数码创意将为全世界研究人员一个更有用的资源来帮助我们解开许多癌症的复杂性。”

重要的是,在NCI和基础医学数据库中,所有患者的信息都被剔除了,这意味着个人信息,如地址、社会安全号码和其他可能的标识符,并不是当前的——只有关键的基因数据和关键的人口统计信息是可用的。

“我们很荣幸能参与这项改变患者护理的重要全球努力,并成为第一个向NCI的GDC贡献数据的商业实体,我们相信这强调了基础医学数据库中包含的基因组信息的质量、完整性和丰富性,”文森特·米勒医学博士说。基金会医学的首席医疗官“基金会医学数据库中的基因组信息已经达到了前所未有的规模。从发布的数据中收集到的见解将有助于加速靶向药物和免疫疗法的研究和开发工作。”

由美国国立卫生研究院数据获取委员会批准的基因组学信息可被授权的研究人员使用。请求者必须确认,他们使用这些数据仅仅是为了生物医学研究目的以及在科学期刊或研究会议上发表或展示。ob欧宝直播nba


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芝加哥大学的基因组数据共享系统开启了癌症数据共享的新时代

引用:基因组共用数据(2016年6月29日)中可用数据的显著扩展,2021年4月27日从//www.puressens.com/news/2016-06-significant-expansion-genomic-commons.html检索
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