人工智能揭示脑瘤背后的机制
乌普萨拉大学(Uppsala University)的研究人员使用计算机建模来研究脑肿瘤是如何发生的。这项研究今天发表在该杂志上EBioMedicine,说明了将来的研究人员如何使用大规模数据来寻找新的疾病机制并确定新的治疗目标。
过去十年在分子生物学上的进展彻底改变了癌症研究人员的工作方式。如今,大规模的统计分析被越来越多地用于了解肿瘤疾病和寻找新的治疗方法,而不是几乎完全使用不同的生物模型,如细胞。
乌普萨拉大学的研究人员与哥德堡大学、查尔默斯理工大学和弗莱堡大学的同事一起开发了一种新的算法,aSICS,它使用大量数据提出关于癌细胞中“什么引起什么”的假设。
在今天发表的研究中,研究人员使用ASIC来解释数据脑部肿瘤他们还能发现间充质胶质母细胞瘤(一种特别具有侵袭性的脑肿瘤类型)背后的新机制。
“根据计算机模型,间充质胶质母细胞瘤部分由称为膜蛋白A2的基因的改变部分引起。为了验证这种预测的相关性,我们检查了来自患者的样本,并且可以表明间充质胶质母细胞瘤具有增加的膜蛋白A2活性。随后,我们测试以抑制Annexin A2的表达癌细胞来自患者的发现,癌症细胞死于或改变为不太侵略性的形式,在乌普萨拉大学的免疫学,遗传学和病理学系中,Lvs Nelander表示,他与弗赖堡的一位同事一起导致了这项研究。
结果表明,数据分析可用于预测哪种基因或蛋白质影响肿瘤的发育,然后确认在实验室中的实验预测。ASICS方法也在其他类型上进行了测试癌症如有前途的结果,虽然需要进一步研究来微调设置。
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