联合开发技术以确定癌症的遗传和环境原因

通过开发一种新颖、廉价的基因分型微阵列OncoArray，达特茅斯大学的研究人员领导了一项关键的合作研究，这将彻底改变我们对常见癌症原因的认识。

OncoArray由23万人组成单核苷酸多态性(SNPs)，每一个都代表了单个DNA组成部分或核苷酸的差异。这些变异可以作为生物标记，帮助科学家定位与癌症相关的基因，并更好地了解癌症的发展和遗传风险疾病基因．

一个主要的困难是需要协调一个从世界各地收集SNP样本和数据的联盟。为了解决这一挑战，达特茅斯大学的研究人员，在达特茅斯大学教授、诺里斯·棉花癌症中心临时主任克里斯托弗·阿莫斯博士的带领下，组成了一个由多个机构组成的财团，由多个来源提供资金。该联盟已经开发了SNP选择、位点选择、基因分型和祖先分析准确性的质量控制方法。Amos解释说:“我们正在寻求了解常见癌症的原因，包括遗传和环境，以及它们的相互作用。”该联盟的目标和目的的细节，“OncoArray联盟:理解常见癌症遗传结构的网络”，最近发表在癌症流行病学生物标志物．

该联盟在总共494,763个通过质量控制步骤的SNPs中对447,705个样本进行了基因分型，成功率为97%。这些分析的结果将使研究人员能够识别和绘制与多种癌症相关的新的易感性位点，评估疾病特异性风险，并模拟遗传、环境和生活方式相关的暴露。“我们为基因分型开发的新平台非常成功，使我们能够以高精度和低成本查询超过44万人。这种方法将使我们能够确定影响癌症风险的大量新的遗传因素，并梳理出环境因素的作用，”Amos解释说。“初步研究已经确定了100多个导致常见癌症的新位点，包括肺癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌。此外，这项新技术还被应用于胶质瘤、头颈癌和睾丸癌的研究，并提供了关键的见解。”

Amos预计将会有几十篇论文通过联合分析得出。其中第一篇分析口腔癌和咽喉癌易感位点的论文已于本月发表在《自然遗传学》杂志上。

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