研究人员揭示基因组景观core-binding因子急性髓系白血病(aml)

一个国际研究小组的研究人员圣裘德儿童研究医院——华盛顿大学的儿科癌症基因组项目(PCGP)已经完成了一个详细的地图core-binding基因组景观的因素(CBF-AML)急性髓系白血病。突变的工作揭示了景观的差异导致CBF-AML的多样性。研究结果今天在线发表在《华尔街日报》自然遗传学。

“我们了解基因变异导致CBF-AML使用whole-exome和全基因组测序的发展,”杰弗瑞Klco说,医学博士博士,助理的圣裘德病理学和这项研究的主要作者之一,随着詹姆斯·r·唐宁,医学博士张,历程,博士,圣裘德和拉斯布林格,医学博士博士在德国乌尔姆大学的。“我们的目标是定义一个详细的突变景观更好地理解导致疾病的基因变化。”

CBF-AML AML占大约30%的儿童和15%的成人病例。研究人员测序样本87名儿童和78名成年人,发现两组类似的突变景观。在17例,完整的基因组序列。Whole-exome测序进行剩余的148个样本。

科学家已经知道了一段时间,两个基因,RUNX1 CBFB,可以影响染色体重组在AML。这些基因编码的蛋白质core-binding因素(CBF)复杂的一部分,一个转录复杂的血液细胞的正常发展的必要条件。CBF-AML出现染色体重组,损害CBF复杂的活动。虽然CBF-AML患者大量积累的异常细胞称为髓爆炸和成熟血细胞的严重短缺,很明显,这些染色体重组不是足够的癌症的发展。这促使科学家寻找其他突变与基因重组共同努力,会导致白血病。

“一个或多个突变白血病需要合作,“Klco说。“我们的分析显示显著差异的遗传景观这些突变与重组涉及RUNX1 CBF-AML合作涉及CBFB相比。”

研究人员分析了几个突变可能引起突变,合作包括CCND2变化,基因蛋白参与细胞周期。新的周期性突变也确认,包括改变DHX15,修改某些类型的RNA。

“突变的长度缩短CCND2都围绕着的一端蛋白质,糖,和导致稳定的细胞周期蛋白D2和细胞周期激活,”张说,圣裘德计算生物学部门的主席。“许多我们发现的突变干扰分子信号或表观遗传因素。”

其他基因识别,包括可能导致CBF-AML ASXL2 ZBTB7A和公司。“一些突变,如ASXL2,后生修改当地的监管机构的染色质状态。其他人,像ZBTB7A,似乎像肿瘤抑制,”Klco说。

作者李丁博士,助理主任麦克唐奈基因组研究所和计算生物学主任分部的肿瘤在圣路易斯的华盛顿大学医学院,指出:“我们继续发现支撑不同类型的AML基因变化和突变。这说明这种严格的遗传分析的价值定义基因组景观和学习特定的基因突变导致疾病。”

CBF-AML患者预后相对较好。然而,一些病人的疾病反复。“在某些情况下我们还可以看看突变的类型在诊断和复发CBF-AML了解疾病的变化随着时间的推移,我们希望建立在这项工作向前发展,“Klco说。

“这项研究突显出儿科癌症基因组计划继续产生新的见解基因改变和合作突变引起疾病像AML,”唐宁说,圣裘德总裁兼首席执行官。“结果显示的新组件数量可能在CBF-AML功能作用,也彰显出基因可能是至关重要的患者复发的风险。”

而研究结果表明,这些新组件在疾病中发挥作用,下一步是确认他们的精确功能在这种类型的白血病。进一步的研究已经展开,充分评估不同基因的贡献以及新发现的角色基因改变在CBF-AML。