ACMG对基因组测序的次要发现报告提出了新的建议

为了促进2013年美国医学遗传学和基因组学（ACMG）的临床基因组测序的标准化报告，2013年，发表了最低目的列表，以在外壳或基因组测序期间作为二次结果报告。目标是通过旨在预防或显着降低发病率和死亡率的既定干预措施识别和管理所选高度渗透遗传疾病的风险。随后，在2014年，ACMG建立了次级调查结果维护工作组（SFWG），开发了定期策划和更新推荐基因列表的过程。

现在，ACMG发布了一份备受期待的最新政策声明，“临床外显子组和基因组测序次要发现报告的建议，2016年更新:美国医学遗传学和基因组学学院的政策声明”，其中有四项新基因添加到推荐的次要结果列表中，以及从2013年列表中消除了早期基因之一。新的更新的次要发现列表 - ACMG SF v2.0 - 包括推荐用于临床基因组测序返回的59个医学上可操作的基因。

更新政策声明在ACMG的同行评议期刊，医学遗传学,在http://www.nature.com/gim/journal/vaop/ncurrent/abs/gim2016190a.html。

波士顿儿童医院的医学遗传学家、ACMG二级发现工作组的联合主席David T. Miller说:“更新的ACMG二级发现列表保留了原始列表的精神和意图。”米勒说:“这份新名单也反映了ACMG的承诺，即让基因学界对哪些基因可以纳入有发言权，从而进一步为人们提供对他们的健康结果有巨大影响的信息。”

ACMG更新的政策声明包括:

• 对寻找定义的，仔细考虑的基因名单的理由审查，该基因列表是在进行基因组尺度测序的个人中的审查;
• 制定在接受和评估纳入或排除基因的提名时进行的严格进程;
• 添加新基因的列表，以及添加或删除一个基因的支持性证据;
• 次要调查结果的未来焦点领域维护工作组，包括考虑药物替补体变异的可能性，扩大提名过程并评估二次结果的影响。

“申请新的过程，同时坚持原始政策陈述的核心原则，导致添加四种基因和去除一个基因;一个基因提名在ACMG SF v2.0中未达到包含的标准，ACMG执行董事Michael S. Watson说。

2015年3月至2016年5月，由SFWG收到和评估了六名提名。其中一种PTCH1与Gorlin综合征/ Nevoid基础细胞癌综合征有关，并未实现SFWG共识，因为由于基因中已知或预期的致病变异的知识的证据不足，因此可以改变医学管理。另外四个基因 - BMPR1A和SMAD4，与幼儿息肉病，与威尔逊病相关的ATP7B相关，与鸟氨酸转基氨基甲酰胺缺乏有关的OTC接受来自SFWG成员的一致投票，以添加到列表中。目前在列表中的一种基因，与家族胸主动脉瘤和解剖相关联的MyLK。ACMG董事会随后审查并批准了SFWG的六项建议中的每一个：排除PTCH1，添加BMPR1A，SMAD4，ATP7B和OTC，以及删除MYLK。

“最新政策声明”也讨论了更多有关评审程序的细节，例如提名表格、可诉性评分的确定、评审程序等。

今后，该小组计划接受其他医疗专业组织的提名。ACMG还打算开发资源，根据具体的二次调查结果协助临床医生进行医疗管理。

据景国卫生系统和ACMG二级调查结果的联合主席自闭症发育医学研究所主任Christa Martin博士，SFWG计划每年更新清单一次或两次;我们'对临床实验室的潜在负担敏感，每次更新清单时都需要对其生物信息学分析流水线进行更改的潜在负担。此外，每个修订版都将有一个新的版本控制号码和实现日期，以便于参考。“

---

---