对于患有脑瘤的儿童，下一代测序可能会导致不同的诊断

UCSF医疗中心患者的下一代测序正在促使脑肿瘤诊断的变化，对某些儿童进行诊断和在许多情况下的治疗计划的重新处理。测序还向某些父母提供了有价值的见解，这些父母对其他看似无关的癌症的敏感性。

在期刊上发表的突破性研究中神经肿瘤学2016年11月14日，UCSF临床调查人员记录了从31名儿科患者中测序510例脑组织相关基因的结果，其脑肿瘤高等级，治疗耐药或具有含糊不清的特征。

在UCSF临床癌症基因组学实验室进行测序，全国少数医院设施之一，临床型肿瘤，并将其与患者的正常组织进行比较，鉴定驱动肿瘤生长并将它们与靶向疗法相匹配的任何突变。

根据疾病控制和预防的中心，脑肿瘤现在是儿童癌症死亡的头号原因。自1999年以来，小儿脑肿瘤死亡略有增加，而白血病的死亡率，最常见的儿童癌症，均有下降。

在这项研究中，研究人员将病理学家显微镜下的初步诊断结果与专门研究脑肿瘤遗传学的分子病理学家发现的基因改变进行了比较。显微镜下的发现包括细胞形态、细胞分裂率和肿瘤侵袭性等特征。

6例患者的不同诊断

测序结果证实了31名患者中的25名的病理报告，其余6名儿童的诊断由于基因发现而改变。在一个值得注意的病例中，一个9岁的孩子在肿瘤分级“不确定”，影像学特征“提示为高级别浸润性肿瘤”后，已经开始了积极的治疗。测序结果显示肿瘤为非恶性肿瘤，复发可能性低，因此停止化疗。

“在这种精密药物的时代，我们正在改变诊断和治疗的范式，”UCSF医疗中心病理部助理教授博士，博士，博士，博士，博士，博士，博士，博士助理教授。“我不认为基因组分析将取代显微镜下的病理学家的作用。我们现在使用UCSF500癌症基因面板实现的是将基因组分布的结果与下列的组织学特征相结合显微镜，为脑肿瘤的儿童产生最准确的诊断。“

在31名患者中的19名，研究人员发现了现有治疗方法可能针对的基因改变。靶向治疗的毒性比化疗要小，化疗不分青红皂白地攻击癌细胞和非癌细胞。突变包括特定于肿瘤的非遗传性体细胞突变，以及与儿童癌症有关的种系突变，这种突变可在外周血中发现，也可在身体的每个细胞中发现。

较少的突变促进有针对性疗法的希望

虽然成年肿瘤通常具有许多突变，但儿科患者的肿瘤可能只有一两个。

“因为儿童肿瘤的基因改变往往显著减少，我们希望靶向治疗将对儿童更有效，”所罗门说，他也是UCSF临床癌症基因组实验室的一名主治分子病理学家。

“我们目前使用UCSF500癌症基因面板对大脑肿瘤进行约60名儿童测序，这组病例特别有趣和有前景。UCSF具有世界着名的神经病理学和神经肿瘤学群体，他们共同努力诊断，确定肿瘤遗传学，并患者对临床试验或获得有针对性的治疗，“UCSF病理学助理教授的第一作者南希约瑟夫，博士说，博士学位，致力于验证临床的UCSF500癌症小组用。

“分子病理学家可以告诉我们,根据突变的类型和肿瘤有多么普遍,如果突变被认为是推动肿瘤的增长,”共同通讯作者说,尼克莱德斯西奥多,助理教授,儿科和儿童医院神经外科UCSF贝尼奥夫旧金山。ob体育开户网址

血脑屏障因子

“如果驱动突变已被证明对其他肿瘤类型的特定药物有反应，并且我们有证据表明它可以穿过血脑屏障，我们认为这种药物有很大的成功机会。”但这些结果来自于少数患者，应该谨慎解读，”他说。

Co-First Author Cassie Kline，MD，UCSFBenioff儿童医院旧金山的儿科血液学 - 肿瘤学诊所，所述序列的主要好处之一是鉴定种系突变，包括在子宫中传递的不可遗传的突变来自精子和鸡蛋，以及从患者的父母继承的那些，这可能会揭示他们自己的成人发病癌症的风险以及任何其他孩子的风险。

“随着某些癌症倾向综合征的发现，我们更能够避免风险可能超过患者的某些疗法，例如患有种系TP53突变的患者的辐射，”她说，指的是最常见的改变之一癌症。“至少，他们允许我们更加周到待遇决定。”

研究人员发现，31个孩子中有11个有种系突变。其中一名患有神经管母细胞瘤的5岁儿童发现了PALB2突变，神经管母细胞瘤是最常见的儿科疾病之一脑部肿瘤。本基因中的突变已被认为是提高成人乳腺癌，卵巢癌和胰腺癌的风险。这与母亲和父母侧面的乳腺癌史相相对应，该家族称为UCSF癌症风险诊所。

“我们惊讶地惊讶于，很多孩子都有致病性遗传突变“所罗门说，”好消息是，曾经家庭意识到他们的风险增长，他们可以参考遗传咨询，他们可以学习如何最佳地管理风险。“

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