三组基因可以预测对类风湿关节炎治疗的反应

根据本周在华盛顿举行的美国风湿病学会年度科学会议上公布的最新研究结果，三种基因表达特征可以帮助风湿病学家预测哪些患者对中度至重度类风湿性关节炎患者的肿瘤坏死因子抑制剂(TNFi)或b细胞耗尽疗法更有可能产生反应。

类风湿关节炎(RA)是一种慢性疾病，会导致疼痛、僵硬、肿胀和多个关节的运动和功能受限。虽然关节是受风湿性关节炎影响的主要部位，但其他器官也可能发生炎症。据估计，有130万美国人患有类风湿性关节炎，女性患病的几率通常是男性的两倍。

根据ORBIT研究的数据，这是一项针对英国风湿性关节炎患者的随机对照试验，研究人员寻找基因表达这些标记将有助于预测对TNFi药物或b细胞疗法利妥昔单抗或两者的反应。

ORBIT数据“显示血清阳性的患者类风湿性关节炎与抗tnf治疗相比，利妥昔单抗治疗同样可能有反应，”苏格兰格拉斯哥伊丽莎白女王大学医院名誉副教授和风湿病专家顾问邓肯·波特医学博士说，他是该研究的主要作者之一。“然而，很大一部分患者对他们的第一种生物药物没有反应，但当他们改用替代药物时却有反应。如果我们能在血液中识别出预测患者最有可能对哪种药物产生反应的标记物，那么我们就能在一开始就为患者选择最佳治疗方案，而不是依赖于反复试验的方法。”

波特博士和他的同事们在首先耗尽核糖体和珠蛋白RNA后，对参与ORBIT研究的241名RA患者的外周血RNA进行了测序。他们使用70%的样本来开发响应预测模型，并保留30%用于验证。治疗的临床反应定义为DAS28-ESR(疾病活动评分)在基线和3个月之间下降1.2个单位。他们使用多种机器学习工具来预测TNFi和利妥昔单抗的一般反应和差异反应。他们还使用十倍交叉验证来训练模型的响应性，然后在验证样本上进行测试。

使用支持向量机递归特征消除，研究人员确定了预测治疗反应的三个基因表达签名。8个基因预测了对TNFi和利妥昔单抗的一般反应性，23个基因预测了对TNFi的反应性，23个基因预测了对利妥昔单抗的反应性。

研究人员还在验证集上测试了他们的预测模型，这导致ROC(受试者工作特征)图点的AUC(曲线下面积)为一般响应性的91.6%，TNFi响应性的89.7%和利妥昔单抗响应性的85.7%。

“确实有基因表达标记可以预测药物特异性反应，”波特博士说。“如果得到证实，这将允许将患者分层为更可能对一种药物而不是另一种药物有反应的组。这将导致更高的反应率，并降低接受无效药物试验的可能性。因为无效的治疗与疼痛、僵硬、残疾和生活质量下降有关，这将导致更好的患者护理。”

波特博士说，确认这些模型是该领域研究的下一步。

“这些发现需要使用靶向RNA测序或内部验证来确认，然后在新的患者队列中进行测试，或进行外部验证。最终，一种商业测试套件将被开发出来，让临床医生进行测试病人在他们接受治疗之前，指导他们进行最有效的治疗，”他说。